More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0590 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  100 
 
 		 268 aa  544  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  60.92 
 
 		 256 aa  345  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  59.7 
 
 		 256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  57.47 
 
 		 258 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.55 
 
 		 272 aa  318  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.49 
 
 		 257 aa  316  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  53.11 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  52.75 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  55.06 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  51.53 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  53.24 
 
 		 280 aa  302  5.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  51.96 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  52.43 
 
 		 266 aa  299  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  55.25 
 
 		 260 aa  298  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  51.34 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  52.49 
 
 		 259 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  52.9 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  49.24 
 
 		 264 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  48.85 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  48.85 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  48.85 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  48.85 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  48.85 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  48.85 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  48.85 
 
 		 264 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  48.85 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  48.85 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  48.85 
 
 		 276 aa  279  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  49.05 
 
 		 267 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  50 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 269 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 251 aa  165  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  37.69 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.21 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6106  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2027  response regulator receiver  32.26 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1645  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.53 
 
 		 669 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00749578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  31.25 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2573  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0970392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  32.43 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000851  probable transcriptional regulator SyrB  33.33 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00675785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 122 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1035  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  30.43 
 
 		 1340 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.54 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0873  protein-glutamate methylesterase  38.53 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  36.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  36.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06763  transcriptional regulatory protein CpxR  31.17 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  34.75 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2590  response regulator  30.48 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0044189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.02 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4102  DNA-binding response regulator  35.51 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4024  DNA-binding response regulator  35.51 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2877  DNA-binding response regulator  31.02 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0131  two component transcriptional regulator  35.51 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.364585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0080  two component LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2366  DNA-binding response regulator  30.48 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.74 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2666  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.800154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  34.43 
 
 		 122 aa  72  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  34.33 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5596  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.35 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  35.92 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  31.3 
 
 		 122 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2893  response regulator  30.48 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000624978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2621  two-component response regulator  30.48 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000897138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2867  DNA-binding response regulator  30.48 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000859212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  31.3 
 
 		 122 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 118 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  31.3 
 
 		 122 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 122 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  27.94 
 
 		 1374 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  35.92 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 123 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  34.33 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  31.3 
 
 		 122 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  31.3 
 
 		 122 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.82 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  31.3 
 
 		 122 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 119 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2910  DNA-binding response regulator  30.48 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>