More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1894 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  100 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  72.6 
 
 		 269 aa  418  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  62.28 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  61.21 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.8 
 
 		 258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 260 aa  321  9.000000000000001e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  57.04 
 
 		 266 aa  315  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  52.67 
 
 		 256 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  54.38 
 
 		 269 aa  313  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  52.31 
 
 		 256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 256 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  53.93 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.51 
 
 		 272 aa  310  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  54.93 
 
 		 280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.51 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  51.96 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  52.88 
 
 		 288 aa  298  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  53.26 
 
 		 259 aa  298  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  52.52 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  52.16 
 
 		 276 aa  295  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  52.16 
 
 		 276 aa  295  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  49.82 
 
 		 264 aa  295  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  51.8 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  51.8 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  51.8 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  51.8 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  51.8 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  52.16 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  52.16 
 
 		 276 aa  294  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  50.54 
 
 		 266 aa  289  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  50 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  49.28 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  39.11 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 1003 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  44.25 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.91 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.97 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  39.81 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  40 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3532  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.91 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.998897  normal  0.150916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  35.66 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  34.1 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.28 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  42.59 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.63 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.18 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  40.18 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.94 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  39.29 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  39.25 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.74 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  42.2 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  37.19 
 
 		 146 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  42.2 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.9 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  35.71 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.58 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.19 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5315  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.813269  normal  0.296683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4521  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 1711 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 119 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03275  two-component system, transcriptional regulatory protein  38.46 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  36.88 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 1349 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  37.19 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  42.2 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.34 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.84 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1415 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  32.37 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5742  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0760421  hitchhiker  0.00137021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2573  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0970392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  39.05 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.27 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.22 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>