More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4023 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  100 
 
 
288 aa  595  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  96.72 
 
 
276 aa  551  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  97.08 
 
 
276 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  97.08 
 
 
276 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  96.72 
 
 
276 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  97.08 
 
 
276 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  97.08 
 
 
276 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  95.99 
 
 
276 aa  547  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  95.99 
 
 
276 aa  547  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  97.35 
 
 
264 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  96.21 
 
 
264 aa  527  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  81.68 
 
 
259 aa  441  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  78.93 
 
 
259 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  58.27 
 
 
266 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  57.3 
 
 
276 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  56.93 
 
 
276 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.32 
 
 
258 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.14 
 
 
272 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.83 
 
 
257 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  55.13 
 
 
256 aa  308  8e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  56.93 
 
 
269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  56.49 
 
 
256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  54.58 
 
 
256 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  52.88 
 
 
281 aa  298  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  53.58 
 
 
260 aa  298  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  51.15 
 
 
264 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  55.13 
 
 
266 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  48.85 
 
 
268 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  52.16 
 
 
280 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  51.69 
 
 
262 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  44.61 
 
 
267 aa  255  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  44.62 
 
 
269 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  33.46 
 
 
251 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.99 
 
 
339 aa  92.4  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 
219 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  34.62 
 
 
342 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  35.9 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  33.8 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12543  Transcriptional regulator  36.8 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204025  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
430 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 
239 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 
221 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  33.61 
 
 
1374 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4067  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.54 
 
 
218 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.352272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 
232 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
117 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  38.53 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  39.45 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.13 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
1003 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  36 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.05 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.05 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2573  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 
221 aa  79  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0970392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  36.13 
 
 
122 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  35.29 
 
 
122 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  35.29 
 
 
122 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
122 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  35.67 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  34.75 
 
 
151 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  38.39 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
226 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2537  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.82 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  34.88 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  39.45 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  38.53 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  38.53 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  35.29 
 
 
122 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  35.29 
 
 
122 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  35.29 
 
 
122 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0732  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.45 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298385  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  35 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  37.5 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  35.29 
 
 
122 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  35.29 
 
 
122 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.74 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  31.67 
 
 
120 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  32.37 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  37.78 
 
 
619 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
121 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  35.71 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  30.32 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0873  protein-glutamate methylesterase  35.66 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 
212 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  35.2 
 
 
411 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.59 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  35.29 
 
 
122 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
1299 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.9 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 
212 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  30.91 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4152  chemotaxis-specific methylesterase  33.56 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.412207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>