More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2497 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  100 
 
 		 266 aa  540  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  58.05 
 
 		 269 aa  317  9e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  57.04 
 
 		 281 aa  315  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  57.3 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  57.36 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  57.36 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  57.36 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  57.36 
 
 		 276 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  57.36 
 
 		 276 aa  295  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  57.36 
 
 		 276 aa  295  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  57.36 
 
 		 276 aa  295  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  57.36 
 
 		 276 aa  295  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  56.55 
 
 		 264 aa  293  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.27 
 
 		 259 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  53.1 
 
 		 257 aa  291  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  55.13 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  55 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  51.65 
 
 		 276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  51.28 
 
 		 276 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  53.64 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  50.57 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  50.18 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  50 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  48.86 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  50.19 
 
 		 256 aa  271  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  48.86 
 
 		 266 aa  268  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  47.19 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  48.12 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  48.12 
 
 		 267 aa  261  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  47.06 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  48.68 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  38.49 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 119 aa  89.4  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 119 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.73 
 
 		 350 aa  85.9  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  42.34 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  34.75 
 
 		 122 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  33.9 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  33.9 
 
 		 122 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  35 
 
 		 144 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  33.9 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  33.9 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  33.9 
 
 		 122 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 123 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  33.9 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  33.9 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  38.98 
 
 		 120 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  33.9 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 117 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.38 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 120 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 1003 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.07 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  39.34 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 119 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 120 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 		 1431 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  34.42 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 122 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 120 aa  78.2  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 120 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.29 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 123 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.74 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  32.5 
 
 		 1299 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.74 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  34.96 
 
 		 121 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03429  two-component system response regulator (hybrid family) protein  30.3 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4113  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 126 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0232733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 122 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 121 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 120 aa  77.4  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2877  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.412079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1561  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.62 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 1415 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 120 aa  77  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3304  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.37 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.836526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>