More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2425 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  100 
 
 		 251 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  39.08 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  39.11 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  39.38 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  38.15 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  37.78 
 
 		 276 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  40.93 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  38.22 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  38.49 
 
 		 266 aa  164  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  35.77 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  37.83 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  32.95 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  34.08 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  35 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  33.46 
 
 		 288 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  33.21 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  33.21 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  34.87 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  33.08 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  33.08 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  33.08 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  33.08 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  33.08 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  33.08 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  32.69 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  32.69 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 391 aa  85.5  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.22 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.14 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  36.91 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3519  chemotaxis-specific methylesterase  30.19 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.480358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.29 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.18 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1645  chemotaxis-specific methylesterase  30.19 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1757  chemotaxis-specific methylesterase  30.19 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.982649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 122 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.4 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.59 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.62 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  32.34 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.7 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  35.03 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  36.75 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.07 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.07 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.07 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.35 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  31.74 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.79 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  33.57 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.57 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.57 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.62 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.57 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.19 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  33.57 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.57 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.57 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4227  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.54 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  31.74 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  32.87 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2454  chemotaxis-specific methylesterase  40 
 
 		 349 aa  72  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1859  chemotaxis-specific methylesterase  28.5 
 
 		 350 aa  72  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.57 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  40 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1857  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.48 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1637  response regulator  33.61 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1606  response regulator  32.03 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.75 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.57 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  37.74 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1913  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.605645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.06 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2455  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46136  normal  0.292815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 1385 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.21 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.36 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 159 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>