More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5540 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 		 200 aa  390  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  80.3 
 
 		 204 aa  326  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  72.49 
 
 		 194 aa  287  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  70.5 
 
 		 205 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  73.8 
 
 		 210 aa  285  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  73.8 
 
 		 210 aa  285  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  73.8 
 
 		 210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  75.4 
 
 		 213 aa  284  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  73.26 
 
 		 229 aa  280  8.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  71.5 
 
 		 207 aa  278  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  70.62 
 
 		 206 aa  277  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  70.1 
 
 		 206 aa  275  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.23 
 
 		 199 aa  272  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  67.53 
 
 		 206 aa  270  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  66.67 
 
 		 199 aa  268  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  69.35 
 
 		 212 aa  265  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  66.84 
 
 		 207 aa  258  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  67.38 
 
 		 220 aa  256  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.13 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  61.19 
 
 		 201 aa  255  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  67.39 
 
 		 197 aa  255  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  67.38 
 
 		 214 aa  254  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  68.11 
 
 		 199 aa  254  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  65.78 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  69.57 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.78 
 
 		 227 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  66.31 
 
 		 220 aa  251  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  60.2 
 
 		 201 aa  251  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  67.03 
 
 		 200 aa  249  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  62.89 
 
 		 229 aa  247  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  66.49 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  70.81 
 
 		 207 aa  245  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.93 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  60.62 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  63.98 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.85 
 
 		 197 aa  216  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  48.61 
 
 		 261 aa  209  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  57.53 
 
 		 189 aa  209  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.3 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54.4 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  51.65 
 
 		 194 aa  204  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  51.65 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  49.52 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  52.36 
 
 		 203 aa  184  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  49.18 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.54 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.7 
 
 		 194 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.31 
 
 		 196 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.99 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.46 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  46.45 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.76 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.15 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.81 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.96 
 
 		 221 aa  158  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  36.9 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.25 
 
 		 218 aa  154  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.86 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.31 
 
 		 220 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.04 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.86 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.46 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.25 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.01 
 
 		 194 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  40.98 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.01 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.16 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.78 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  42.96 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.89 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.26 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.55 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 636 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  40.69 
 
 		 352 aa  104  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 450 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  34.52 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  46.09 
 
 		 667 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 377 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 355 aa  99.4  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  31.89 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 450 aa  99  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.26 
 
 		 195 aa  98.2  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0569  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.13 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000937079  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 386 aa  97.8  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  42.24 
 
 		 380 aa  96.7  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 		 257 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.72 
 
 		 224 aa  94.7  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 316 aa  94.7  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 123 aa  94.7  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.7 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 359 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 384 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  43.27 
 
 		 122 aa  92.8  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.09 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 376 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.15 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  40 
 
 		 429 aa  91.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>