More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1086 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  82.03 
 
 		 258 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  78.52 
 
 		 256 aa  427  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  70.43 
 
 		 256 aa  380  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  68.48 
 
 		 257 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  64.07 
 
 		 272 aa  354  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 268 aa  333  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  55.68 
 
 		 264 aa  324  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  54.85 
 
 		 269 aa  317  9e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  52.67 
 
 		 281 aa  314  9e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  54.87 
 
 		 276 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  58.53 
 
 		 259 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  54.51 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  58.3 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  58.27 
 
 		 266 aa  309  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  56.87 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  56.87 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  56.87 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  56.87 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  56.87 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  56.87 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.49 
 
 		 288 aa  305  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 280 aa  305  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  56.87 
 
 		 276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  56.7 
 
 		 264 aa  305  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  56.49 
 
 		 276 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  56.49 
 
 		 276 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  55.98 
 
 		 260 aa  301  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  56.2 
 
 		 262 aa  298  7e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  52.09 
 
 		 269 aa  279  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  51.72 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  47.33 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  39.38 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.98 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.53 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6106  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  36.75 
 
 		 934 aa  81.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.02 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.43 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 1385 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0237  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390769  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.91 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1794  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 1349 aa  79  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0314  two component transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  40.57 
 
 		 120 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2316  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000147543  hitchhiker  0.000888492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 941 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0953  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 119 aa  77.8  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0255772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 1118 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.04 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  31.29 
 
 		 1340 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2666  two component transcriptional regulator  38.58 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.800154  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  41.96 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1739  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1714  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 1361 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.9 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.66 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  25.74 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1032  response regulator  33.06 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0894814  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  37.96 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.51 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  35.14 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2590  response regulator  39.5 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0044189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1431 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  33.9 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0851  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0778308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  35.59 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  40 
 
 		 118 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>