More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0812 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  72.6 
 
 		 281 aa  418  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  61.23 
 
 		 276 aa  344  7e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  61.96 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.34 
 
 		 258 aa  325  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  56.3 
 
 		 269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  58.05 
 
 		 266 aa  317  9e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  61.45 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  54.85 
 
 		 256 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  57.79 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  57.03 
 
 		 257 aa  311  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  58.65 
 
 		 259 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  57.03 
 
 		 256 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.93 
 
 		 288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  55.06 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  53.16 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  56.82 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  56.82 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  57.2 
 
 		 264 aa  305  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  56.82 
 
 		 276 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  56.82 
 
 		 276 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  56.44 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  56.44 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  56.44 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  56.44 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  56.44 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.02 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  50 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  54.87 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  50.55 
 
 		 267 aa  285  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  49.25 
 
 		 266 aa  272  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  49.24 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  39.08 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.86 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  42.73 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.74 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 1003 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27980  chemotaxis response regulator; CheB  42.11 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.151486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2020  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  40.35 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5612  chemotaxis-specific methylesterase  38.6 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3786  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.5 
 
 		 370 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3060  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.5 
 
 		 370 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.652621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0801  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3693  chemotaxis-specific methylesterase  38.6 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236536  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2573  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0970392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.45 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.45 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03275  two-component system, transcriptional regulatory protein  37.29 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  28.38 
 
 		 1347 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1494  chemotaxis protein CheY  36.36 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3532  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.18 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.998897  normal  0.150916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 1711 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  40.37 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1415 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.19 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7833  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.84 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1075  chemotaxis-specific methylesterase  39.47 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 		 1426 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2257  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.56 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 1385 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4374  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.71 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6788  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.43 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322604  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0571  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.74 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.691339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4166  chemotaxis-specific methylesterase  43.52 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4054  chemotaxis-specific methylesterase  43.52 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.47 
 
 		 215 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  35 
 
 		 392 aa  72  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0046  chemotaxis-specific methylesterase  38.94 
 
 		 345 aa  72  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000324346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 212 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1403  chemotaxis-specific methylesterase  43.52 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.551695  normal  0.0191361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2854  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 1431 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0071  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3177  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.97 
 
 		 214 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  37.19 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 123 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3429  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.03 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1689  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  33.08 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3850  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3931  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2846  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0177184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0243  chemotaxis-specific methylesterase  37.84 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1770  chemotaxis-specific methylesterase  39.25 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.221833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>