More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0256 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  91.51 
 
 		 259 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  78.93 
 
 		 276 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  78.93 
 
 		 276 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  78.93 
 
 		 264 aa  428  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  78.54 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  78.54 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  78.54 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  78.93 
 
 		 288 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  78.54 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  78.54 
 
 		 264 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  78.54 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  78.54 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  61.15 
 
 		 266 aa  331  7.000000000000001e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  57.79 
 
 		 269 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.64 
 
 		 257 aa  311  5.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  58.3 
 
 		 256 aa  310  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  55.72 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  57.92 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.89 
 
 		 272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  56.32 
 
 		 256 aa  305  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  56.09 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  56.59 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  53.26 
 
 		 281 aa  298  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  54.26 
 
 		 260 aa  291  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  52.49 
 
 		 268 aa  289  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  55 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  51.44 
 
 		 280 aa  284  8e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  50.38 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  53.26 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  47.51 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  46.92 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  34.87 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2573  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 221 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0970392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 218 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4067  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 218 aa  89  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.352272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.37 
 
 		 344 aa  88.6  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 217 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.71 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 215 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  32.8 
 
 		 339 aa  85.9  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.24 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0985  chemotaxis protein-glutamate methylesterase  40.37 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  35.77 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1337  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  37.17 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.241681  normal  0.456966 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1930  chemotaxis-specific methylesterase  44.04 
 
 		 355 aa  82  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.61 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 122 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.66 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  35 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1417  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.31 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.433973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 117 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2165  chemotaxis-specific methylesterase  43.64 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.29 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5878  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 441 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.464013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3220  chemotaxis-specific methylesterase  40.91 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.184496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.08 
 
 		 466 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  29.88 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12543  Transcriptional regulator  33.05 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 1003 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 		 214 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.6 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  35.83 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2019  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  32.5 
 
 		 122 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.82 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  35.29 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  34.75 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1615  chemotaxis-specific methylesterase  42.2 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0606419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  31.93 
 
 		 120 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  35.92 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>