More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1781 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1781  Spo0A protein  100 
 
 		 276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2067  Spo0A protein  98.55 
 
 		 276 aa  554  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  62.28 
 
 		 281 aa  353  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0812  response regulator receiver protein  61.23 
 
 		 269 aa  344  7e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1505  response regulator receiver protein  54.61 
 
 		 256 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  57.72 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1546  response regulator receiver protein  58.52 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2041  sporulation transcriptional activator Spo0A  55.6 
 
 		 258 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2865  response regulator receiver protein  56.93 
 
 		 264 aa  314  9e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1086  response regulator receiver protein  54.87 
 
 		 256 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4023  sporulation transcriptional activator Spo0A  56.93 
 
 		 288 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0869765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4243  stage 0 sporulation protein A  57.09 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0766925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4301  stage 0 sporulation protein A  57.09 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.794835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4076  stage 0 sporulation protein A  57.09 
 
 		 276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000149935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3914  stage 0 sporulation protein A  57.09 
 
 		 276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000973306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3925  stage 0 sporulation protein A  57.09 
 
 		 276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4394  stage 0 sporulation protein A  57.09 
 
 		 264 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.206267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3481  sporulation transcriptional activator Spo0A  55.88 
 
 		 272 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0151287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4192  stage 0 sporulation protein A  57.09 
 
 		 276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17859e-22 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1615  response regulator receiver protein  55.07 
 
 		 256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0952  stage 0 sporulation protein A  56.57 
 
 		 276 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.023849  hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4282  stage 0 sporulation protein A  56.57 
 
 		 276 aa  311  9e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0590  response regulator receiver protein  52.75 
 
 		 268 aa  310  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0256  sporulation transcriptional activator Spo0A  55.72 
 
 		 259 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1689  response regulator receiver protein  53.99 
 
 		 280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  50 
 
 		 264 aa  298  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1392  sporulation transcriptional activator Spo0A  54.51 
 
 		 257 aa  298  9e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.664762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3087  response regulator receiver protein  51.3 
 
 		 269 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000156547  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1337  sporulation transcriptional activator Spo0A  51.81 
 
 		 267 aa  288  7e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.190748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1767  sporulation transcriptional activator Spo0A  49.82 
 
 		 266 aa  284  9e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06590  response regulator receiver protein  50.74 
 
 		 262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232495  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  51.28 
 
 		 266 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2425  response regulator receiver protein  38.15 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000315639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.07 
 
 		 234 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 391 aa  86.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.07 
 
 		 234 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0109  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  44.44 
 
 		 342 aa  85.9  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3972  two component transcriptional regulator  41.54 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 1003 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1792  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.8 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.1 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  36.67 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.2 
 
 		 466 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  35.83 
 
 		 122 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  35.83 
 
 		 122 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  35.83 
 
 		 122 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 122 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 122 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  40.15 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 123 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  35.83 
 
 		 122 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  35.83 
 
 		 122 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3722  response regulator receiver  37.3 
 
 		 143 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  35.83 
 
 		 122 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.93 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  35.83 
 
 		 122 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  35.83 
 
 		 122 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0583  response regulator receiver protein  33.81 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  40.15 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  39.53 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0161  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0654  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4321  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  36.44 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1014  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  36.59 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  36.59 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  41.22 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3200  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.11 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000259787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  37.4 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  36.59 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  37.4 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  36.59 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  40.15 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  36.59 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  36.59 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  36.59 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  41.22 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0944  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  43.24 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0246262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4969  DNA-binding response regulator  38.02 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5049  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>