More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2988 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1402  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.39 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  41.6 
 
 		 234 aa  205  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1291  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000572556  hitchhiker  0.0000375019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1879  DNA-binding response regulator  44.12 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000557668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0507  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0622  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 240 aa  186  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1342  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0144629  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.83 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 234 aa  182  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1334  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 243 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0768  two component signal transduction response regulator  41.67 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000566504  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  39.51 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  39.51 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.26 
 
 		 230 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4388  DNA-binding response regulator  38.49 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.55 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.84 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  35.98 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  38.27 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  38.27 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3821  response regulator receiver  37.5 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  35.42 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.6 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  37.97 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  38.14 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 230 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  38.14 
 
 		 235 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  38.14 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  38.14 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  38.14 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  38.14 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  38.14 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  38.14 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  38.14 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.93 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  39.18 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  41.15 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  39.18 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.32 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 230 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 237 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  37.66 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  36.25 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  34.73 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  41.49 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  37.66 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  41.32 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  37.3 
 
 		 239 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  34.87 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  40.25 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.02 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.15 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  39.57 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.87 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  36.86 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  37.66 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  37.14 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1242  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  35.02 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  37.82 
 
 		 234 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 234 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  37.55 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4054  two component transcriptional regulator  39.08 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 238 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>