More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1291 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1291  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000572556  hitchhiker  0.0000375019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1879  DNA-binding response regulator  86.81 
 
 		 238 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000557668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1334  two component transcriptional regulator  79.91 
 
 		 243 aa  400  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1342  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.97 
 
 		 234 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0144629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.11 
 
 		 234 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0507  two component transcriptional regulator  75.32 
 
 		 236 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.93 
 
 		 235 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0768  two component signal transduction response regulator  63.04 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000566504  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3446  response regulator receiver  49.13 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.664648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 236 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0622  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1402  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154165 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.53 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  41.99 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4168  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.75 
 
 		 237 aa  167  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  40.95 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0895  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.93 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  39.48 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  39.91 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4388  DNA-binding response regulator  35.27 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  37.71 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.18 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  42.15 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.23 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.87 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  41.42 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  38.63 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  39.46 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  41.42 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  41.42 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  38.3 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.3 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.3 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5944  osmolarity response regulator  37.87 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  38.3 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  38.3 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 		 243 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  38.3 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68700  osmolarity response regulator  37.87 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  38.3 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  41 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  37.87 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  37.87 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 239 aa  158  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  42.48 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 230 aa  158  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 239 aa  158  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  40.08 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  41 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.06 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  38.05 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.81 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>