More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0886 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  94.01 
 
 		 334 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  100 
 
 		 334 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.47 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.1 
 
 		 335 aa  338  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  50 
 
 		 331 aa  338  8e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  50.75 
 
 		 331 aa  338  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  50.3 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  50.3 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  50.3 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  50.3 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  50.3 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  50.3 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  50.3 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.82 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  46.26 
 
 		 376 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.55 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 331 aa  332  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  48.8 
 
 		 331 aa  332  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  49.1 
 
 		 331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.25 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  46.99 
 
 		 331 aa  320  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.96 
 
 		 330 aa  315  8e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  44.85 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  44.44 
 
 		 339 aa  275  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  40.84 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  42.64 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  42.34 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  40.06 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.59 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  33.64 
 
 		 322 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  33.53 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  30.75 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.67 
 
 		 203 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  59.83 
 
 		 121 aa  149  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  51.69 
 
 		 122 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  51.69 
 
 		 122 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  51.69 
 
 		 122 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  51.69 
 
 		 122 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  51.69 
 
 		 122 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  51.69 
 
 		 122 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 122 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 122 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  48.76 
 
 		 122 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 122 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 122 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 122 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 122 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  50 
 
 		 184 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  50 
 
 		 122 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  50 
 
 		 122 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  50 
 
 		 122 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  50 
 
 		 208 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  50 
 
 		 208 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  50 
 
 		 122 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  47.86 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  50.43 
 
 		 117 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  48.76 
 
 		 121 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  46.22 
 
 		 121 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  44.17 
 
 		 121 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.21 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  42.74 
 
 		 132 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.14 
 
 		 207 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  25.23 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.63 
 
 		 207 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  32.22 
 
 		 202 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.5 
 
 		 204 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  38.14 
 
 		 126 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 127 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 118 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  27.64 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 120 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  28.42 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  28.42 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  28.42 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.96 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.96 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  32.09 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.5 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.5 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.5 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 123 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.95 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  32.62 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  32.62 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  32.62 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  32.62 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  32.62 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  32.62 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  32.62 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 125 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 125 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.54 
 
 		 952 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  28.57 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 124 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.55 
 
 		 212 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1556  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.77 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>