More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1059 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  100 
 
 
127 aa  253  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  57.98 
 
 
123 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  49.12 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  42.98 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
118 aa  93.6  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.71 
 
 
331 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  43.36 
 
 
331 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.59 
 
 
331 aa  91.3  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.46 
 
 
331 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  41.59 
 
 
331 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  38.46 
 
 
331 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  41.12 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  40.71 
 
 
331 aa  90.1  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
331 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
331 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
331 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
331 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
331 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
331 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.82 
 
 
335 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  38.94 
 
 
331 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.59 
 
 
331 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  44.12 
 
 
344 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  36.52 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.46 
 
 
342 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  37.61 
 
 
376 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  37.84 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  40.19 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  40.19 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  40.19 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  41.28 
 
 
346 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  40.19 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  40.19 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  42.61 
 
 
119 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  38.94 
 
 
334 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  37.38 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  36.45 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  36.45 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  36.45 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  38.26 
 
 
119 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  37.38 
 
 
122 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  40 
 
 
119 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  40.68 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  38.94 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  36.45 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  36.45 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  36.45 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  40.68 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  40.68 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  40.68 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  40.68 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  40.68 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  40.68 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  40.68 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  40.68 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  38.32 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  36.45 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  37.5 
 
 
334 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  34.51 
 
 
334 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  38.05 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  36.45 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  36.45 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  40.5 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 
120 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
119 aa  80.1  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  40.5 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  36.45 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  36.45 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  36.45 
 
 
208 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  36.45 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  35.85 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  36.45 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
321 aa  78.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  35 
 
 
456 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.97 
 
 
389 aa  77.8  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  32.48 
 
 
338 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  33.93 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  35.64 
 
 
334 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
120 aa  76.6  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  35.09 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  36.11 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.09 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.58 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.83 
 
 
457 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>