101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4957 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  99.04 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  91.94 
 
 		 211 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  92.79 
 
 		 208 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  92.79 
 
 		 208 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  92.79 
 
 		 208 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  89.71 
 
 		 204 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  67.31 
 
 		 207 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  74.62 
 
 		 207 aa  272  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  64.42 
 
 		 207 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  74.62 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  74.62 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  74.62 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  74.62 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  74.62 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  74.62 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  74.62 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.94 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  41.2 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  41.31 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  41.31 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  41.31 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  40.1 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  31.19 
 
 		 376 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  30.2 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.19 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.82 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.67 
 
 		 331 aa  99.8  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 331 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.03 
 
 		 331 aa  99  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 331 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 331 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 331 aa  99  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 331 aa  98.2  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  34.34 
 
 		 331 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.83 
 
 		 331 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.26 
 
 		 333 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  33.67 
 
 		 331 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.34 
 
 		 331 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  34.18 
 
 		 331 aa  95.1  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  30.96 
 
 		 334 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  30.96 
 
 		 334 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  27.59 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  27.75 
 
 		 338 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  29.47 
 
 		 339 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  28 
 
 		 331 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  28.78 
 
 		 194 aa  86.3  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  30.85 
 
 		 334 aa  84.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.5 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  31.68 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  29.85 
 
 		 334 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.84 
 
 		 342 aa  78.2  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  27.4 
 
 		 344 aa  75.1  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.93 
 
 		 330 aa  74.7  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  27.88 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.65 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.27 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.23 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.37 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.52 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.2 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.27 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.53 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.85 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.35 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.41 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  28.89 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  27.72 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.26 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.1 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.9 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.71 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.53 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.53 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.48 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.48 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.62 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.93 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  16.18 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.59 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.25 
 
 		 417 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  31.65 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.69 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  48.78 
 
 		 346 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  48.78 
 
 		 346 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.9 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  47.62 
 
 		 375 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  21.65 
 
 		 395 aa  45.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.16 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.86 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.76 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  27.88 
 
 		 411 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.52 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.56 
 
 		 207 aa  42  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>