146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3200 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  100 
 
 		 204 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  88.73 
 
 		 204 aa  357  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  63.08 
 
 		 202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.54 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.46 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.56 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.39 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.9 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.23 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.79 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.06 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.12 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.29 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  39 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.93 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  40 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.78 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.71 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.68 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.09 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.87 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.63 
 
 		 217 aa  122  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.17 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.42 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.82 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.16 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.53 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.79 
 
 		 204 aa  96.3  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.02 
 
 		 546 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  30.5 
 
 		 200 aa  91.7  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.34 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.34 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.27 
 
 		 218 aa  84.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.64 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  29.53 
 
 		 1010 aa  82  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.5 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.5 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.35 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.51 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.65 
 
 		 406 aa  68.2  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  31.18 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.95 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.45 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2156  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.32 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220055  normal  0.484045 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.56 
 
 		 406 aa  65.5  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.61 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.49 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2720  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.17 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.18 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.18 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.78 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.79 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.6 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.89 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0957  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.51 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3148  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.08 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.2 
 
 		 399 aa  62  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.49 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.06 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.12 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.63 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.8 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.51 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.37 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.87 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  31.79 
 
 		 360 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  47.37 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  47.37 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  47.37 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  47.37 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.51 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2852  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.22 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0462024  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  30.66 
 
 		 375 aa  54.7  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0257  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.22 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.33 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.21 
 
 		 370 aa  54.3  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.08 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.18 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.05 
 
 		 381 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.37 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.73 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0738  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.88 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.972818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1723  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.45 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.348388  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.17 
 
 		 357 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  29.5 
 
 		 339 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  30.97 
 
 		 406 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.63 
 
 		 331 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.63 
 
 		 331 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1724  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.61 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.96 
 
 		 375 aa  48.5  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  23.26 
 
 		 546 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.87 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  23.53 
 
 		 545 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  22.86 
 
 		 546 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.22 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  25 
 
 		 402 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.17 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  22.67 
 
 		 546 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>