70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1981 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.47 
 
 
204 aa  107  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.75 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.59 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  25.13 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.74 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.57 
 
 
223 aa  67.8  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.24 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.08 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.24 
 
 
219 aa  61.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.5 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  18.69 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  27.66 
 
 
190 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.79 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  18.59 
 
 
207 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  20 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  25.17 
 
 
194 aa  58.2  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  18.97 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.69 
 
 
209 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.69 
 
 
209 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.45 
 
 
213 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.68 
 
 
203 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.2 
 
 
333 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  23.7 
 
 
202 aa  48.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  19.29 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.44 
 
 
330 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  20.94 
 
 
327 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.43 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  23.86 
 
 
321 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.76 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  19.7 
 
 
548 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.21 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.83 
 
 
335 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  19.9 
 
 
546 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  20.69 
 
 
546 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  20.69 
 
 
546 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  20.69 
 
 
546 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.7 
 
 
546 aa  45.1  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  20.69 
 
 
546 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  20.69 
 
 
546 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  20.3 
 
 
545 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.71 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.27 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  25 
 
 
339 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  15.08 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  23.12 
 
 
338 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  19.4 
 
 
546 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.32 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  19.8 
 
 
546 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  22.28 
 
 
331 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  22.28 
 
 
331 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  22.28 
 
 
331 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  22.28 
 
 
331 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.17 
 
 
331 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  16.08 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  16.08 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  16.18 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  16.08 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.4 
 
 
206 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  16.08 
 
 
208 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.55 
 
 
203 aa  42  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.89 
 
 
203 aa  42  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  21.74 
 
 
331 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.46 
 
 
204 aa  41.6  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  21.74 
 
 
331 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  21.74 
 
 
331 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.74 
 
 
331 aa  41.6  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  21.74 
 
 
331 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  22.13 
 
 
376 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  16.08 
 
 
211 aa  41.2  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>