60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0335 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
214 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.64 
 
 
213 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.17 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.04 
 
 
211 aa  95.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.84 
 
 
206 aa  92  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.56 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.46 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.04 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.8 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.11 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.11 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.57 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.57 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.95 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.82 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.44 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  24.76 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.05 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  30.56 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.71 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.7 
 
 
202 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.53 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.86 
 
 
204 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.73 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.64 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  24.69 
 
 
360 aa  48.9  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.48 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.34 
 
 
208 aa  48.5  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.4 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.32 
 
 
370 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.34 
 
 
210 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.32 
 
 
201 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  25.59 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.53 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.64 
 
 
197 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  21.79 
 
 
417 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  24.59 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.22 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.41 
 
 
217 aa  45.4  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  22.29 
 
 
401 aa  45.1  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.76 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.84 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.56 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  26.67 
 
 
401 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  19.78 
 
 
393 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  25 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  25 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  25 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.03 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.04 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.45 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.53 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.94 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.7 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.12 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.58 
 
 
198 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  21.15 
 
 
395 aa  42.4  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  20.13 
 
 
422 aa  42  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.62 
 
 
207 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>