132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2688 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
205 aa  403  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.73 
 
 
206 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.74 
 
 
205 aa  209  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  54 
 
 
205 aa  204  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  49.75 
 
 
205 aa  197  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.85 
 
 
207 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.63 
 
 
208 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.93 
 
 
210 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.35 
 
 
211 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  41.29 
 
 
204 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.06 
 
 
212 aa  155  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.81 
 
 
207 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.8 
 
 
204 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.71 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  37 
 
 
213 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.29 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.46 
 
 
202 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.76 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.76 
 
 
206 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.06 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.14 
 
 
210 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.95 
 
 
205 aa  121  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.36 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.5 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.5 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.5 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.79 
 
 
198 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.95 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.62 
 
 
203 aa  94.7  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  32.02 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  31.75 
 
 
1010 aa  87.8  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.95 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.11 
 
 
357 aa  82.4  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.55 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  29 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  38.1 
 
 
378 aa  78.2  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  36.49 
 
 
546 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  36.49 
 
 
546 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  36.49 
 
 
546 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  36.49 
 
 
546 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  36.49 
 
 
546 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.32 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  35.81 
 
 
546 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  35.81 
 
 
545 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.37 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.76 
 
 
375 aa  72  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.64 
 
 
546 aa  68.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  30 
 
 
406 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
213 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  34.69 
 
 
554 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2720  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.98 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  35.14 
 
 
546 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.62 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  33.8 
 
 
422 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.62 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.49 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  35.14 
 
 
548 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  35.14 
 
 
546 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  30.07 
 
 
401 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
406 aa  62  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.46 
 
 
217 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  29.86 
 
 
393 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.71 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.34 
 
 
401 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  32.47 
 
 
346 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  35.51 
 
 
402 aa  60.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2852  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.27 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0462024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.73 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.73 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.15 
 
 
199 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.13 
 
 
223 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  32.87 
 
 
572 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.03 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.94 
 
 
417 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.26 
 
 
202 aa  58.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 
346 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2156  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.71 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220055  normal  0.484045 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.39 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.37 
 
 
406 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  35.11 
 
 
375 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.56 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  32.09 
 
 
411 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.23 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.84 
 
 
418 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  29.29 
 
 
395 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  33.58 
 
 
381 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  28.97 
 
 
360 aa  55.1  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.74 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1723  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.35 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.348388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.35 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.35 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  23.04 
 
 
321 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  29.14 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.51 
 
 
398 aa  51.6  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  29.14 
 
 
206 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  29.14 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0935  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.84 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  19.89 
 
 
403 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  28.99 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>