141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2046 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
213 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  88.68 
 
 
213 aa  370  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  64.02 
 
 
211 aa  262  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  59.31 
 
 
212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  56.57 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.76 
 
 
219 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.82 
 
 
208 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  36 
 
 
202 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.75 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.16 
 
 
209 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.16 
 
 
209 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  32 
 
 
206 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.5 
 
 
220 aa  101  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  29.65 
 
 
321 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.51 
 
 
199 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.64 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.74 
 
 
212 aa  91.7  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.15 
 
 
207 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.12 
 
 
406 aa  81.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  27.75 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  27.75 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  27.75 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.64 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  27.27 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.95 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.88 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.43 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.02 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.89 
 
 
331 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.74 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  28.78 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.62 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.37 
 
 
331 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.98 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.32 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  27.37 
 
 
331 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.86 
 
 
198 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.46 
 
 
217 aa  61.6  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  26.18 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.23 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  25.63 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.98 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  28.78 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  24.42 
 
 
338 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.98 
 
 
331 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  22.5 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  26.46 
 
 
331 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.84 
 
 
335 aa  59.3  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  26.46 
 
 
331 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.15 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  26.46 
 
 
331 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  26.46 
 
 
331 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.24 
 
 
204 aa  59.3  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.21 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  26.84 
 
 
331 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.29 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.2 
 
 
403 aa  58.5  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.51 
 
 
406 aa  58.2  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  26.5 
 
 
331 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  27.42 
 
 
334 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  25.87 
 
 
331 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  27.98 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  27.98 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.16 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.53 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  27.46 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  27.98 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  27.98 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  27.98 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  27.98 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  27.98 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.59 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  28.49 
 
 
334 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.95 
 
 
370 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.86 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.67 
 
 
546 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  26.13 
 
 
331 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  26.13 
 
 
331 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  25.93 
 
 
331 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.47 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.58 
 
 
357 aa  55.5  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0935  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.71 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  28.89 
 
 
339 aa  55.1  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.47 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.5 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.95 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.36 
 
 
331 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.32 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.75 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.75 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 
399 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.57 
 
 
418 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.78 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  25.44 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.59 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.62 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.57 
 
 
422 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.66 
 
 
333 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>