126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2940 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
206 aa  410  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.06 
 
 
208 aa  109  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.89 
 
 
199 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  32 
 
 
213 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.5 
 
 
213 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.14 
 
 
219 aa  99  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.5 
 
 
202 aa  94.7  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.67 
 
 
209 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.67 
 
 
209 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.84 
 
 
214 aa  89.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.41 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.84 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.41 
 
 
207 aa  89  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.48 
 
 
211 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  30.57 
 
 
321 aa  85.5  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  29 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.92 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.61 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.89 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.85 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.41 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.56 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.83 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.08 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.64 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.44 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.5 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.12 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.28 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  31.61 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  28.86 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0738  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.55 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.972818  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.8 
 
 
335 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.75 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.46 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.37 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.53 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  23.08 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  27.86 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  27.86 
 
 
206 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  27.86 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0258  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.6 
 
 
202 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  27 
 
 
203 aa  62  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1724  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.26 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  33.58 
 
 
339 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  32.58 
 
 
346 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.98 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.54 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.18 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.15 
 
 
205 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  26.88 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  26.42 
 
 
334 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.18 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.86 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.95 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.1 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.18 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.83 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.85 
 
 
406 aa  55.1  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  27.81 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.21 
 
 
333 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.45 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  25.65 
 
 
331 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  25.65 
 
 
331 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.65 
 
 
331 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  25.13 
 
 
331 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.64 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  25.65 
 
 
331 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  25.13 
 
 
331 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  25.13 
 
 
331 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  25.13 
 
 
331 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  25.13 
 
 
331 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0178  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.26 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  28.36 
 
 
338 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  25.13 
 
 
331 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  25.13 
 
 
331 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  25.13 
 
 
331 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  24.48 
 
 
334 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.39 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  24.73 
 
 
1010 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  27.27 
 
 
331 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.7 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.08 
 
 
331 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.37 
 
 
330 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  25.35 
 
 
406 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.61 
 
 
331 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.26 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  24.5 
 
 
376 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.79 
 
 
331 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.85 
 
 
205 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.71 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.6 
 
 
422 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.2 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  28.79 
 
 
344 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.2 
 
 
546 aa  48.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.37 
 
 
198 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.4 
 
 
208 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>