125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2383 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  56.59 
 
 
207 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.37 
 
 
213 aa  187  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.5 
 
 
205 aa  187  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.15 
 
 
211 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.03 
 
 
210 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.1 
 
 
201 aa  167  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  45.36 
 
 
206 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.03 
 
 
207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.7 
 
 
205 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.28 
 
 
208 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.29 
 
 
205 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.49 
 
 
205 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.31 
 
 
212 aa  148  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  39 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  37 
 
 
204 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.07 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.11 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.29 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.33 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.84 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.2 
 
 
206 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.67 
 
 
210 aa  122  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.49 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.03 
 
 
198 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.82 
 
 
203 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.41 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  28.92 
 
 
1010 aa  88.6  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  33.33 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.46 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.77 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  26 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.42 
 
 
546 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.7 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.89 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.4 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.77 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.44 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.22 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.22 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.85 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.11 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.11 
 
 
206 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  30.71 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  29.92 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  29.92 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  29.92 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.96 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.4 
 
 
418 aa  58.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  29.14 
 
 
321 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  30.71 
 
 
395 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.73 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.17 
 
 
357 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.77 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.77 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.88 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.66 
 
 
212 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.41 
 
 
381 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.35 
 
 
422 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.88 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.27 
 
 
220 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.41 
 
 
375 aa  52  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.62 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  29.23 
 
 
360 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.56 
 
 
370 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0257  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.43 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  27.7 
 
 
546 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2852  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.03 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0462024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  29.5 
 
 
378 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  27.21 
 
 
546 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  27.21 
 
 
546 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  27.21 
 
 
546 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  27.21 
 
 
546 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  27.4 
 
 
554 aa  48.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  27.03 
 
 
546 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  23.26 
 
 
401 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  28.17 
 
 
548 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  27.21 
 
 
546 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.49 
 
 
207 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  27.21 
 
 
546 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  27.78 
 
 
545 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.59 
 
 
333 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.39 
 
 
346 aa  46.2  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.88 
 
 
399 aa  45.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.15 
 
 
331 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  31.15 
 
 
331 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  24.21 
 
 
198 aa  45.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0739  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.66 
 
 
229 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.91151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.81 
 
 
369 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  29.93 
 
 
346 aa  45.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  26.24 
 
 
339 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  27.07 
 
 
372 aa  45.1  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  30.33 
 
 
331 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.12 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.35 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  30.65 
 
 
331 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>