64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1035 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  31.47 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.57 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.76 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  32.14 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.75 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  29.61 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.34 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.44 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  25.49 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.1 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  26.71 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.37 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  29.58 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.53 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.5 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.77 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.8 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.77 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  21.03 
 
 		 346 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.23 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.39 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.62 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.83 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.39 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.23 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  23.39 
 
 		 338 aa  49.3  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.56 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.17 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.94 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  23.5 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.3 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.9 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.28 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.62 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.83 
 
 		 331 aa  45.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.46 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  21 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.52 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.34 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.52 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.04 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.52 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  21.43 
 
 		 376 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  21.51 
 
 		 406 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  24.03 
 
 		 331 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  19.5 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.48 
 
 		 331 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.76 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.69 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.26 
 
 		 331 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  22.48 
 
 		 331 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.11 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  22.83 
 
 		 331 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  23.86 
 
 		 360 aa  42.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.1 
 
 		 330 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.26 
 
 		 331 aa  41.2  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>