108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0602 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  38.97 
 
 		 194 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  35.75 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.69 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.69 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.05 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  29.85 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.69 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  30.35 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  30.35 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  30.35 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.69 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.68 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.68 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.68 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.19 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.2 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.8 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  32.18 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.47 
 
 		 335 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  26.04 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  27.64 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.7 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  32.18 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  32.18 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  32.18 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  32.18 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  32.18 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  32.18 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  32.18 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 331 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  27.87 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  28.92 
 
 		 331 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  28.92 
 
 		 331 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  28.92 
 
 		 331 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  29.02 
 
 		 331 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  28.92 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.32 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  28.27 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.36 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  24.37 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  30.05 
 
 		 331 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.33 
 
 		 331 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1035  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.61 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  27.42 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  24.75 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  27 
 
 		 333 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.17 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.41 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  25.17 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  22.8 
 
 		 338 aa  57.8  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  26.88 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.79 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  29.2 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.58 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.17 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  25.7 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  30 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.54 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.78 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  35.23 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  28.11 
 
 		 334 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  27.13 
 
 		 334 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.21 
 
 		 401 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.23 
 
 		 331 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.24 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  32.58 
 
 		 402 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  28.28 
 
 		 395 aa  51.6  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.85 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  27.57 
 
 		 334 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  26.57 
 
 		 378 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.39 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.4 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  27.78 
 
 		 406 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  25.9 
 
 		 554 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  26.28 
 
 		 548 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  27.74 
 
 		 546 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  27.74 
 
 		 545 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.89 
 
 		 398 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  26.28 
 
 		 546 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  28.4 
 
 		 411 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.18 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.18 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  25.55 
 
 		 546 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  25.55 
 
 		 546 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  25.55 
 
 		 546 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  25.55 
 
 		 546 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  26.28 
 
 		 546 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.74 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  25.55 
 
 		 546 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.26 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.42 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  26.42 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  24.09 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  35.21 
 
 		 572 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.61 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.22 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>