123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1439 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.05 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.7 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.71 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.41 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.15 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1981  hypothetical protein  24.75 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.58 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  26 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.24 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.57 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.94 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  30.1 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  30.1 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  30.1 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  27.27 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  29.13 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.26 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  27.98 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.14 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.37 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.96 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.23 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  26.71 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  25.14 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  25.29 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.79 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.59 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.88 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.59 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.33 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.86 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  27.89 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.35 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.35 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  25.17 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.44 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.42 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.35 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.35 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.52 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.96 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.82 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.37 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.33 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.84 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.37 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  23.15 
 
 		 331 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.53 
 
 		 331 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.08 
 
 		 331 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  22.86 
 
 		 1010 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.24 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.9 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  22.99 
 
 		 331 aa  52.4  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.92 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.08 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.16 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  22.99 
 
 		 331 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  22.99 
 
 		 331 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  22.99 
 
 		 331 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  22.99 
 
 		 331 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  25.76 
 
 		 344 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.89 
 
 		 546 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  27.81 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.43 
 
 		 331 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  22.46 
 
 		 331 aa  48.5  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  23.44 
 
 		 334 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.65 
 
 		 335 aa  48.5  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  23.96 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.68 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  20.59 
 
 		 376 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.61 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  20 
 
 		 338 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  21.93 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  21.93 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  21.93 
 
 		 331 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.49 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.3 
 
 		 370 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.73 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  21.98 
 
 		 331 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.3 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.04 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  20.59 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  24.06 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  25.67 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  25.67 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.08 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  25.67 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  25.67 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  25.67 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  25.67 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  25.67 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.47 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  20.6 
 
 		 344 aa  45.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.04 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  22.97 
 
 		 546 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  21.36 
 
 		 331 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.87 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.37 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  22.97 
 
 		 546 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>