More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3578 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3578  response regulator  100 
 
 		 376 aa  770    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.52 
 
 		 331 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  54.26 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  53.19 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  53.19 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  53.72 
 
 		 331 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  53.19 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  53.72 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  53.19 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  52.93 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  52.93 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  53.19 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  53.46 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.93 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  52.66 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  52.13 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  53.46 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03100  response regulator  53.49 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  44.89 
 
 		 338 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1379  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.52 
 
 		 330 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.51 
 
 		 333 aa  335  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  46.26 
 
 		 334 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.3 
 
 		 342 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  46.52 
 
 		 334 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  44.68 
 
 		 346 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  45.35 
 
 		 339 aa  311  9e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  40.69 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  42.71 
 
 		 344 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  42.29 
 
 		 334 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  40.96 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0393  CheC, inhibitor of MCP methylation  52.76 
 
 		 203 aa  219  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  33.07 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  27.75 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  62.81 
 
 		 121 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  29.09 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 122 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 122 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.82 
 
 		 207 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 122 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 122 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 122 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 122 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 122 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  45.45 
 
 		 184 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  45.45 
 
 		 208 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  45.45 
 
 		 208 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  47.93 
 
 		 122 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  36 
 
 		 207 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  50.41 
 
 		 121 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 122 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  47.93 
 
 		 122 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  47.93 
 
 		 122 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  47.93 
 
 		 122 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  47.93 
 
 		 122 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  45.45 
 
 		 122 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  47.93 
 
 		 122 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  47.93 
 
 		 122 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  50.83 
 
 		 121 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  45.45 
 
 		 122 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  45.45 
 
 		 122 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  45.45 
 
 		 122 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.83 
 
 		 207 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  46.55 
 
 		 117 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  46.15 
 
 		 117 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.85 
 
 		 204 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  43.33 
 
 		 132 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4294  putative chemotaxis protein  30.65 
 
 		 202 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151857  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2364  CheC family protein  33.33 
 
 		 207 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  29 
 
 		 203 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  29 
 
 		 206 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  28.5 
 
 		 203 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  29 
 
 		 203 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5510  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.19 
 
 		 208 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835873  normal  0.0567884 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2106  hypothetical protein  33.16 
 
 		 207 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2400  CheC family phosphatase  33.16 
 
 		 207 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3166  CheC family phosphatase  33.16 
 
 		 207 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1494  response regulator  33.16 
 
 		 207 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00101274  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1134  CheC family phosphatase  33.16 
 
 		 207 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00229165  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3280  CheC family phosphatase  33.16 
 
 		 207 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0228974  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1414  CheC family phosphatase  33.16 
 
 		 207 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0704685  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4957  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.19 
 
 		 211 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632549  normal  0.0769169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5174  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.2 
 
 		 208 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.65047  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5685  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.2 
 
 		 208 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74554  hitchhiker  0.00173669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4550  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.2 
 
 		 208 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0686054  normal  0.488561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0013  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.2 
 
 		 211 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01457  response regulator  40.83 
 
 		 121 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 127 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2405  CheC family protein  28.18 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01456  hypothetical protein  27.14 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 120 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 118 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 123 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2546  hypothetical protein  30.05 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2214  protein-glutamate methylesterase  39.82 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0602  hypothetical protein  26.04 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>