More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1034 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  236  9e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  48.7 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  47.83 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  47.83 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  44.95 
 
 		 126 aa  95.9  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  47.83 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1124  response regulator  47.83 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2404  response regulator  47.83 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  38.79 
 
 		 344 aa  90.5  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  39.66 
 
 		 322 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  41.23 
 
 		 327 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.97 
 
 		 331 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  41.38 
 
 		 331 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 331 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 331 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 331 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 331 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.38 
 
 		 331 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0601  response regulator  41.67 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 331 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  43.86 
 
 		 331 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 331 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 331 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 331 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.11 
 
 		 331 aa  84.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0087  response regulator receiver protein  46.6 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 331 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.24 
 
 		 335 aa  83.6  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  45.63 
 
 		 117 aa  83.6  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  42.24 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  41.53 
 
 		 376 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  42.24 
 
 		 334 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  46.23 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3836  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 338 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  41.67 
 
 		 334 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.11 
 
 		 331 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  43.75 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  43.4 
 
 		 334 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  42.86 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  41.38 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  42.86 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  42.86 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  38.98 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  42.86 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  42.86 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  42.86 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  41.38 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  42.86 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  42.86 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  41.38 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  41.38 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  41.38 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  41.38 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  41.38 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.07 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  42.34 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  41.59 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  41.51 
 
 		 334 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0614  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000792989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 562 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 1309 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  43.27 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  43.27 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  42.2 
 
 		 344 aa  74.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 1058 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.39 
 
 		 342 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1203 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  40.95 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03705  response regulator  41.76 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.18 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>