More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0913 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3677  response regulator receiver protein  40.73 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1794  response regulator receiver  38.74 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000277143  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  45.71 
 
 		 120 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 119 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 119 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 123 aa  89  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 119 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 128 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 122 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 128 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 119 aa  87  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 120 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 119 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  36.45 
 
 		 121 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 124 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 120 aa  85.9  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 120 aa  85.9  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 118 aa  85.9  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 127 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 128 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 125 aa  85.9  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 122 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 1066 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3857  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 128 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 120 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  37.29 
 
 		 124 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  36.45 
 
 		 120 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 125 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 125 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 120 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  41.44 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 119 aa  83.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 139 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 117 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  36.36 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 120 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1679  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 119 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 121 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 122 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 120 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  36.44 
 
 		 124 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 123 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 126 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 135 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  35.96 
 
 		 120 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 119 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 123 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  38.52 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  38.52 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  37.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  38.18 
 
 		 128 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  35.29 
 
 		 568 aa  80.5  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0623  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 123 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  38.52 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 126 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  37.19 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  35.59 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  35.59 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0915  CheA signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 584 aa  79.3  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  39.83 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  38.89 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  36.29 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  39.83 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  35.59 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  35.59 
 
 		 122 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  35.59 
 
 		 122 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  35.59 
 
 		 122 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 126 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  35.59 
 
 		 122 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  39.62 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  35.59 
 
 		 122 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1448  response regulator receiver protein  37.01 
 
 		 129 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.637441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>