More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0915 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0915  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
584 aa  1166    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1148  CheA signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
377 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  31.13 
 
 
1643 aa  192  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
750 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
740 aa  187  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
741 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
742 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
758 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
781 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
756 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
783 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1147  response regulator receiver protein  45.16 
 
 
188 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
753 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
911 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
705 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.25 
 
 
734 aa  174  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
1065 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  30.25 
 
 
878 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
705 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  29.23 
 
 
839 aa  167  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 
679 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 
679 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
934 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
974 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.33 
 
 
2325 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
706 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
695 aa  163  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  30.91 
 
 
770 aa  163  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  24.88 
 
 
1956 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  27.29 
 
 
768 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  28.54 
 
 
752 aa  161  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  26.65 
 
 
1960 aa  161  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6787  CheA signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
790 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  0.39723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  27.1 
 
 
1992 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  27.66 
 
 
785 aa  161  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
1758 aa  160  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
2212 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  27.35 
 
 
783 aa  159  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.36 
 
 
769 aa  159  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  29.77 
 
 
770 aa  158  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.12 
 
 
769 aa  158  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
808 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.98 
 
 
769 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  25 
 
 
952 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  27.05 
 
 
774 aa  154  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
928 aa  154  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  26.58 
 
 
1987 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  27 
 
 
789 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
756 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  25.31 
 
 
803 aa  152  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
649 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
830 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2547  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
1098 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
760 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  25.42 
 
 
2336 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
1127 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
801 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
777 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  26.96 
 
 
2284 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
808 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
686 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
896 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
941 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
896 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.63 
 
 
764 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
777 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  26.42 
 
 
2301 aa  146  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 
1629 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
706 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3559  putative CheA signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 
1098 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.989868 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  27.72 
 
 
832 aa  145  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
707 aa  145  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4949  CheA signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
1616 aa  144  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
768 aa  144  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5453  CheA signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 
747 aa  144  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
911 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  28.23 
 
 
864 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  28.23 
 
 
864 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
911 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  26.41 
 
 
793 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  28.23 
 
 
864 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  28.23 
 
 
864 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  25.77 
 
 
764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  28.23 
 
 
864 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  28.23 
 
 
864 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  26.65 
 
 
763 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  28.23 
 
 
1079 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
2539 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2957  CheA signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 
758 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0244  CheA signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
747 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970775  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
728 aa  140  6e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
1832 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
1725 aa  140  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
1725 aa  140  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
2009 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
777 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
2012 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
666 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
660 aa  138  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
989 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>