More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1147 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1147  response regulator receiver protein  100 
 
 
188 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0915  CheA signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
584 aa  180  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
2423 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  34.4 
 
 
2458 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  34.4 
 
 
2476 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  41.67 
 
 
878 aa  86.3  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
122 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
2539 aa  84.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
122 aa  84.7  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
121 aa  84.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  35.29 
 
 
221 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  34.45 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
2212 aa  82.8  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
741 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  35.77 
 
 
2284 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.19 
 
 
2336 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  33.06 
 
 
1643 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
1609 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  32.58 
 
 
2301 aa  79  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  35.71 
 
 
1992 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5471  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 
221 aa  79  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00800002  hitchhiker  0.0013378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  34.48 
 
 
121 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  38.33 
 
 
123 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
1974 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6806  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
804 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  31.93 
 
 
1834 aa  78.6  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  35.59 
 
 
2301 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
742 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  38.64 
 
 
734 aa  78.2  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.36 
 
 
1960 aa  77.8  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
1629 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  33.62 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
1646 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
1646 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
1647 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
1907 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
766 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
740 aa  77  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  33.93 
 
 
1987 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  34.48 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
777 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
1832 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
801 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08281  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  39.67 
 
 
388 aa  75.9  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  43.37 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
679 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
911 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  35.9 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
911 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  33.33 
 
 
768 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
865 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
865 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
679 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.23 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 
1971 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2174  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
474 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
1725 aa  74.7  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
1725 aa  74.7  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 
225 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  40 
 
 
230 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
695 aa  74.3  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3089  response regulator receiver domain-containing protein  32.37 
 
 
154 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0429158  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
1758 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
784 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.56 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
772 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  28.69 
 
 
1989 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.66 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  33.87 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
777 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  32 
 
 
762 aa  72.8  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.8 
 
 
1866 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2699  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.824129  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  30.58 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 
798 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.78 
 
 
864 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.78 
 
 
864 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.4 
 
 
387 aa  72  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.78 
 
 
864 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.78 
 
 
864 aa  72  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  31.78 
 
 
832 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  30.47 
 
 
769 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>