More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2699 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2699  response regulator receiver protein  100 
 
 		 233 aa  482  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3307  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.199606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0819  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.309816  decreased coverage  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3204  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0804  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0162077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  41.26 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  39.3 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  37.67 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  37.67 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.17 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  40.6 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0632  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0950707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 242 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  38.43 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0154  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.13097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  39.47 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  39.13 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.13 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  36.16 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  37.13 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 240 aa  157  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.39 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  36.96 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  36.96 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  35.71 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  35.34 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  35.34 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  37.61 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  35.78 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  34.21 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  33.77 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  34.21 
 
 		 241 aa  147  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  37.17 
 
 		 240 aa  148  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>