More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0632 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0632  response regulator receiver protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0950707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0819  two component transcriptional regulator  54.71 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.309816  decreased coverage  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3204  two component transcriptional regulator  54.71 
 
 		 238 aa  238  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3307  two component transcriptional regulator  54.26 
 
 		 240 aa  235  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.199606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0804  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0162077  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2699  response regulator receiver protein  42.22 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  40.26 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  40.44 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  37.1 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  36.44 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.43 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  37.66 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0154  response regulator receiver protein  38.72 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.13097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  36.44 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  36.8 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  37.34 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  38.2 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  37.13 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3920  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  36.49 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  37.67 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2206  two component transcriptional regulator  35.02 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  37.66 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  33.19 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  33.77 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  36.44 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.77 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  38.36 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  38.36 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  38.36 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  38.36 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  38.36 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  38.36 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  38.36 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  38.36 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04421  two-component system regulatory protein  38.77 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1032  response regulator  36.36 
 
 		 232 aa  134  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0894814  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  34.89 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1754  DNA-binding transcriptional regulator RstA  32.49 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0437  response regulator receiver protein  36.09 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  35.37 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  36.24 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>