More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0154 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0154  response regulator receiver protein  100 
 
 		 237 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.13097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  44.87 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  46.12 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  41.77 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 239 aa  191  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.78 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.35 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  40.93 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.04 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  41.88 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  40.51 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.88 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  44.98 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  41.35 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  43.04 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  40.08 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  40.83 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 247 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  41.45 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1754  DNA-binding transcriptional regulator RstA  41.49 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  41.03 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0473  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  41.35 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1937  DNA-binding transcriptional regulator RstA  40.74 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2300  DNA-binding transcriptional regulator RstA  40.74 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.475192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1826  DNA-binding transcriptional regulator RstA  40.74 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.494249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  39.34 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2590  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.31 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  42.26 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2275  DNA-binding transcriptional regulator RstA  40.76 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 242 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3150  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  37.02 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4494  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0681  DNA-binding response regulator  41.1 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2699  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2580  DNA-binding transcriptional regulator RstA  40.59 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  38.63 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1261  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  38.63 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  39.57 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1236  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  39.15 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1591  DNA-binding transcriptional regulator RstA  38.72 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>