More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0938 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 234 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  65.8 
 
 		 237 aa  316  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  64.63 
 
 		 237 aa  308  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  60.09 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  54.77 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4408  two component transcriptional regulator  54.74 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.09 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  53.54 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  51.29 
 
 		 239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  54.42 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  47.95 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  46.35 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.46 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  42.42 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  48.89 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3150  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  48.91 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  48.03 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  45.26 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  44.16 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.4 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  45.8 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  45.8 
 
 		 288 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  45.8 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1754  DNA-binding transcriptional regulator RstA  44.49 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  44.3 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  44.54 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  44.96 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  44.96 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  44.96 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01577  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with RstB  44.81 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.223446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1584  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.53 
 
 		 243 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163508  normal  0.857869 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1643  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.53 
 
 		 243 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15633  normal  0.900528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01567  hypothetical protein  44.81 
 
 		 242 aa  194  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.244563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1575  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.53 
 
 		 243 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1699  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.53 
 
 		 243 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.205168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1867  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.53 
 
 		 243 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0435355  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2035  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.34 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1591  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.34 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1816  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.34 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0513956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2318  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.34 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0386418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1683  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.34 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2022  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.34 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2590  DNA-binding transcriptional regulator RstA  43.88 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3142  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0473  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2580  DNA-binding transcriptional regulator RstA  46.41 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1794  DNA-binding transcriptional regulator RstA  44.77 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0414199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 279 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  43.91 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  41.15 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2275  DNA-binding transcriptional regulator RstA  45.57 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 233 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>