More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3089 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3089  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
154 aa  313  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0429158  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 
708 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
1297 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1555  response regulator receiver protein  47.11 
 
 
134 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.120693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.53 
 
 
1184 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.96 
 
 
865 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.15 
 
 
1391 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1331 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 
1330 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.97 
 
 
1965 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 
1431 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 
955 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  42.34 
 
 
519 aa  100  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.55 
 
 
1478 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 
882 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1557 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0829  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 
155 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0491028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.8 
 
 
1419 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
720 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.73 
 
 
1407 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 
796 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
628 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2037  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0651814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
701 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 
1548 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
653 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
889 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
1808 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.19 
 
 
1002 aa  93.6  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
585 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4537  histidine kinase  36.3 
 
 
257 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 
1501 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
1287 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  42.98 
 
 
678 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
934 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.4 
 
 
680 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  35.07 
 
 
459 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
696 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
587 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
631 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
678 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
697 aa  86.3  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
1361 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  38.73 
 
 
1399 aa  84.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 
1068 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4612  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 
354 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.384861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
606 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
1177 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  37.7 
 
 
725 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  38.35 
 
 
676 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  39.84 
 
 
1131 aa  82  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  34.75 
 
 
399 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
767 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2297  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0617558  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.83 
 
 
933 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.2 
 
 
2213 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
1237 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1767 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  35.48 
 
 
925 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1767 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  35.48 
 
 
925 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1303 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
1160 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1575  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
577 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.420465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
785 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
955 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
1356 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  32.82 
 
 
256 aa  77  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
593 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 
223 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  34.71 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.9 
 
 
1380 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5768  response regulator receiver protein  41.82 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.04 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
932 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
1792 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
1784 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
874 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1771 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 
935 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  32.54 
 
 
1060 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1240 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 
935 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 
662 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 
935 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  35.29 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  37.93 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  37.93 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
916 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
666 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>