More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0829 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0829  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
155 aa  313  5e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0491028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2037  response regulator receiver domain-containing protein  84.52 
 
 
155 aa  265  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0651814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0823  response regulator receiver domain-containing protein  44.72 
 
 
154 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.4 
 
 
708 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.59 
 
 
680 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.4 
 
 
696 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.03 
 
 
606 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
697 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
1331 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.8 
 
 
1431 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
701 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
865 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 
1419 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
934 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
1287 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
628 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
1297 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
889 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  44.63 
 
 
725 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4612  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 
354 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.384861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.97 
 
 
955 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1555  response regulator receiver protein  42.42 
 
 
134 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.120693  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
882 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
1548 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 
796 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
587 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1184 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 
1965 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 
1068 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3089  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 
154 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0429158  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  43.75 
 
 
459 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
1557 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 
1002 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1478 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
663 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
1808 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
1330 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40 
 
 
1407 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.4 
 
 
1408 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  44.07 
 
 
678 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
720 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  44.35 
 
 
1399 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 
653 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
666 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
666 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
656 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1084 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4537  histidine kinase  41.73 
 
 
257 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 
1391 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
664 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
663 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
917 aa  88.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
672 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  40.46 
 
 
796 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
1501 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
585 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 
660 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0549  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1588 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  36.84 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  35.07 
 
 
1384 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  40 
 
 
519 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  37.8 
 
 
537 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  37.61 
 
 
121 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  39.23 
 
 
1131 aa  84  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
1361 aa  84  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
568 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1370  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2054  response regulator receiver protein  32.59 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0880044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.16 
 
 
1361 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
654 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1185 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
922 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
2423 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1160 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  43.97 
 
 
795 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0289  response regulator receiver protein  35.54 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
2539 aa  80.9  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 
572 aa  80.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
664 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
794 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
794 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1246  histidine kinase  33.61 
 
 
762 aa  80.5  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124717  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  37.1 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
927 aa  80.5  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  34.09 
 
 
772 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  34.09 
 
 
771 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  33.85 
 
 
769 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1121 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
1088 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  34.09 
 
 
771 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  34.09 
 
 
771 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  36.92 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  34.09 
 
 
771 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
1352 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>