More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4612 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4612  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
354 aa  710    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.384861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.34 
 
 
1287 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.73 
 
 
1297 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 
628 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.16 
 
 
708 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1555  response regulator receiver protein  48.39 
 
 
134 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.120693  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.38 
 
 
934 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.62 
 
 
865 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.41 
 
 
1557 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  50 
 
 
1407 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.29 
 
 
1548 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 
680 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.53 
 
 
1478 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
701 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 
1965 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 
1431 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0829  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 
155 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0491028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4537  histidine kinase  42.75 
 
 
257 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  50 
 
 
459 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  49.6 
 
 
1399 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.66 
 
 
1331 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.53 
 
 
1419 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
882 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 
796 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2037  response regulator receiver domain-containing protein  42.75 
 
 
155 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0651814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  49.56 
 
 
725 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 
587 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
955 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.03 
 
 
1501 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 
889 aa  99.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
697 aa  99.4  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  43.31 
 
 
1131 aa  99.4  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 
720 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 
1184 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 
696 aa  99.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
653 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 
1808 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
519 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
1330 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
1391 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
1002 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 
1068 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3089  response regulator receiver domain-containing protein  37.1 
 
 
154 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0429158  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 
666 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 
666 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.07 
 
 
656 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
672 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 
1418 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  38.93 
 
 
908 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
585 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 
835 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.3 
 
 
663 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.3 
 
 
664 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
606 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4413  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.529624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0437  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family with PAS/PAC sensor  34.18 
 
 
405 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 
654 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
947 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  34.42 
 
 
796 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1371 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  42.34 
 
 
678 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.48 
 
 
1408 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
794 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
776 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 
794 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 
572 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
1255 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
678 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
631 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
660 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
663 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5655  response regulator receiver protein  38.81 
 
 
935 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  34.52 
 
 
1384 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.39 
 
 
781 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  34.91 
 
 
769 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  38.13 
 
 
810 aa  73.2  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
1088 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5251  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
893 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0456799 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  30.95 
 
 
771 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4394  response regulator receiver protein  34.97 
 
 
906 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0230097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  30.95 
 
 
772 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  30.95 
 
 
771 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  30.95 
 
 
771 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  34.5 
 
 
771 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  34.5 
 
 
771 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
639 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 
1185 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3801  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
981 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.62 
 
 
1514 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
1782 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.79 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6403  response regulator receiver protein  38.06 
 
 
936 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.452757  normal  0.164839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.62 
 
 
1514 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4878  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
991 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.360645  normal  0.0233171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.44 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
964 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5437  response regulator receiver protein  34.93 
 
 
914 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.04493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
1559 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
917 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>