More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4759 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
593 aa  1168    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
579 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
570 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
765 aa  264  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  40.95 
 
 
539 aa  263  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.47 
 
 
846 aa  261  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
864 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
874 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  39.53 
 
 
661 aa  257  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
896 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.95 
 
 
620 aa  256  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
631 aa  256  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  40.22 
 
 
735 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 
1127 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  39.24 
 
 
853 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 
858 aa  253  7e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
932 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
1229 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
1199 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2378  PAS  36.78 
 
 
901 aa  253  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.756345  normal  0.766649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  41.11 
 
 
787 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
859 aa  250  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
847 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.78 
 
 
743 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
641 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
863 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  38.46 
 
 
1560 aa  247  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
1075 aa  247  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 
869 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
572 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.41 
 
 
876 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  37.98 
 
 
729 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  36.45 
 
 
666 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 
554 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
902 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 
947 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
762 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
877 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
781 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
1055 aa  243  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 
1059 aa  243  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  36 
 
 
806 aa  243  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
880 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
969 aa  243  9e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 
631 aa  243  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 
741 aa  243  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
827 aa  243  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
764 aa  242  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 
1195 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
902 aa  242  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
1223 aa  242  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
817 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
846 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
724 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
767 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
870 aa  240  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.53 
 
 
659 aa  240  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  38.61 
 
 
900 aa  239  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
1007 aa  239  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.73 
 
 
853 aa  239  8e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
973 aa  239  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  37.69 
 
 
1028 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
879 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 
602 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  37.35 
 
 
596 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  36.34 
 
 
606 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 
1452 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
918 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
674 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
1407 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 
898 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
873 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
606 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
781 aa  238  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 
614 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 
687 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  34.16 
 
 
732 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  37.57 
 
 
786 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
662 aa  237  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
837 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
873 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  35.92 
 
 
671 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
1691 aa  236  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
1064 aa  236  8e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
772 aa  236  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  34.48 
 
 
736 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 
1135 aa  236  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
667 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3769  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.17 
 
 
582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
969 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.97 
 
 
763 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  34.74 
 
 
882 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.12 
 
 
631 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
1433 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.05 
 
 
951 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
877 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
947 aa  234  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
881 aa  233  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  34.39 
 
 
968 aa  233  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>