More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1148 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1148  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
377 aa  740    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0915  CheA signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
584 aa  283  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
729 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
664 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
989 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  36.46 
 
 
669 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
989 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
713 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
679 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
724 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
724 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2230  CheA signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 
592 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.375764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
536 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
1125 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
772 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.2 
 
 
691 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
674 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
666 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
766 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 
679 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
732 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
701 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
690 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  36.17 
 
 
766 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  26.72 
 
 
807 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
679 aa  123  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
649 aa  122  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.96 
 
 
726 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 
812 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0577  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
556 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.482834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  36.92 
 
 
710 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  34.69 
 
 
692 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
1137 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36 
 
 
1180 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 
666 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
710 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  36.96 
 
 
783 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2176  CheA signal transduction histidine kinases  37.44 
 
 
709 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749003  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
681 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
728 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
656 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  38.12 
 
 
897 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  36.11 
 
 
715 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
725 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
671 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 
653 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  23.83 
 
 
538 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
675 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  33.01 
 
 
673 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  37 
 
 
673 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  36.27 
 
 
667 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  36.27 
 
 
667 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  36.27 
 
 
667 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  36.79 
 
 
670 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  30.81 
 
 
767 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  36.79 
 
 
670 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  30.81 
 
 
767 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  30.81 
 
 
762 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  30.81 
 
 
765 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1979  putative CheA signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 
793 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  30.81 
 
 
765 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
660 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  30.81 
 
 
749 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  32.42 
 
 
719 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4298  putative CheA signal transduction histidine kinases  25.32 
 
 
795 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4068  putative CheA signal transduction histidine kinases  25.32 
 
 
795 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  30.81 
 
 
767 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  30.81 
 
 
767 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
1736 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
1063 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  35.75 
 
 
672 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  35.75 
 
 
667 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  31.82 
 
 
625 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
671 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  30.81 
 
 
744 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  31.82 
 
 
639 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  23.96 
 
 
742 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
694 aa  116  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
686 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
743 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3455  putative CheA signal transduction histidine kinase  25 
 
 
795 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1543  two component signalling adaptor domain-containing protein  35.75 
 
 
468 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.322642  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
750 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
652 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  33.82 
 
 
801 aa  116  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
749 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
687 aa  115  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  35.9 
 
 
729 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
730 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  32.81 
 
 
756 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.22 
 
 
927 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  32.81 
 
 
756 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3969  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
796 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.191505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
673 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
2164 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  32.61 
 
 
703 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
688 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
691 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
761 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3462  putative CheA signal transduction histidine kinases  25.71 
 
 
796 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.924475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>