More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3462 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3969  putative CheA signal transduction histidine kinase  98.49 
 
 		 796 aa  1584    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.191505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4510  putative CheA signal transduction histidine kinase  89.73 
 
 		 803 aa  1380    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1958  sensor histidine kinase  58.3 
 
 		 794 aa  890    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1979  putative CheA signal transduction histidine kinase  90.58 
 
 		 793 aa  1435    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4834  putative CheA signal transduction histidine kinase  65.16 
 
 		 794 aa  1009    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3757  CheA signal transduction histidine kinase  65.16 
 
 		 794 aa  1009    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3011  CheA signal transduction histidine kinases (STHK)  67.61 
 
 		 796 aa  1052    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3590  putative CheA signal transduction histidine kinase  69.42 
 
 		 796 aa  1081    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4298  putative CheA signal transduction histidine kinases  91.08 
 
 		 795 aa  1453    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6986  putative CheA signal transduction histidine kinase  67.61 
 
 		 796 aa  1056    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.813251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3462  putative CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 796 aa  1613    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3455  putative CheA signal transduction histidine kinase  91.33 
 
 		 795 aa  1464    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4068  putative CheA signal transduction histidine kinases  91.08 
 
 		 795 aa  1453    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2118  CheA signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 780 aa  591  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521154  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.18 
 
 		 1023 aa  155  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  36.17 
 
 		 761 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2285  CheA signal transduction histidine kinases  35.71 
 
 		 584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 		 766 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1148  CheA signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  29.41 
 
 		 807 aa  114  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 729 aa  114  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 741 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  48.41 
 
 		 878 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 742 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 671 aa  112  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.26 
 
 		 974 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 687 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 		 2012 aa  112  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 751 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 685 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 685 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  39.08 
 
 		 927 aa  111  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 921 aa  111  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 671 aa  111  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 		 728 aa  111  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 808 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  40.24 
 
 		 715 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  39.08 
 
 		 927 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  52.21 
 
 		 750 aa  110  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  38.85 
 
 		 801 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  37.87 
 
 		 910 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 558 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  40.65 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.65 
 
 		 705 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 1065 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 673 aa  109  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 878 aa  109  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  39.88 
 
 		 561 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  40.61 
 
 		 552 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0603  CheA signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 551 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  48.36 
 
 		 538 aa  108  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  40.61 
 
 		 552 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 1012 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 		 2009 aa  108  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1770  CheA signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 633 aa  108  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 675 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  39.01 
 
 		 610 aa  107  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 		 871 aa  107  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 1974 aa  107  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 935 aa  107  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  41.56 
 
 		 674 aa  107  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 682 aa  107  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 937 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 664 aa  107  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  42.28 
 
 		 739 aa  107  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 937 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0611  CheA signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 		 683 aa  107  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.527763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  46.77 
 
 		 2048 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  43.65 
 
 		 685 aa  107  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 697 aa  107  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 916 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  43.75 
 
 		 887 aa  107  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0628  CheA signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 553 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  40.66 
 
 		 1888 aa  107  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 		 709 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0637  CheA signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 551 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  40.59 
 
 		 916 aa  107  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  37.36 
 
 		 925 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 911 aa  106  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  41.77 
 
 		 684 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 674 aa  106  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 1736 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  37.58 
 
 		 1104 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 607 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 921 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 614 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 934 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 2423 aa  105  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 604 aa  105  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 695 aa  105  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.5 
 
 		 789 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  40.62 
 
 		 785 aa  105  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 603 aa  104  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 606 aa  104  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 814 aa  104  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  37.67 
 
 		 897 aa  104  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  43.86 
 
 		 734 aa  104  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.24 
 
 		 764 aa  104  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.38 
 
 		 2336 aa  104  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 2026 aa  104  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>