More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6986 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3757  CheA signal transduction histidine kinase  72.48 
 
 		 794 aa  1144    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3590  putative CheA signal transduction histidine kinase  73.87 
 
 		 796 aa  1186    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3455  putative CheA signal transduction histidine kinase  67.48 
 
 		 795 aa  1078    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1958  sensor histidine kinase  60.46 
 
 		 794 aa  953    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1979  putative CheA signal transduction histidine kinase  68.38 
 
 		 793 aa  1073    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6986  putative CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 796 aa  1628    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.813251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3969  putative CheA signal transduction histidine kinase  67.99 
 
 		 796 aa  1069    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.191505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4510  putative CheA signal transduction histidine kinase  68.47 
 
 		 803 aa  1064    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3011  CheA signal transduction histidine kinases (STHK)  94.6 
 
 		 796 aa  1508    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4834  putative CheA signal transduction histidine kinase  72.48 
 
 		 794 aa  1144    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4298  putative CheA signal transduction histidine kinases  67.48 
 
 		 795 aa  1075    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3462  putative CheA signal transduction histidine kinases  67.61 
 
 		 796 aa  1061    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4068  putative CheA signal transduction histidine kinases  67.48 
 
 		 795 aa  1075    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2118  CheA signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 780 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521154  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.55 
 
 		 1023 aa  144  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 		 686 aa  124  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  47.06 
 
 		 878 aa  123  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 		 695 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  49.59 
 
 		 700 aa  120  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 2026 aa  120  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  49.59 
 
 		 705 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  42.08 
 
 		 2026 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 		 673 aa  120  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 729 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 		 702 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  37.65 
 
 		 2092 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 		 688 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.14 
 
 		 2336 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 671 aa  118  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  48.41 
 
 		 910 aa  118  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  36.8 
 
 		 1888 aa  118  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 686 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  43.75 
 
 		 2458 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 		 688 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  43.75 
 
 		 2476 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 808 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 699 aa  117  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  46.92 
 
 		 677 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 660 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 671 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 814 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 954 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  48.06 
 
 		 750 aa  116  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 		 686 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  48.78 
 
 		 709 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  36.82 
 
 		 1970 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  39.77 
 
 		 741 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  30.46 
 
 		 669 aa  115  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 694 aa  114  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 		 732 aa  114  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 		 2423 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 		 682 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 681 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0915  CheA signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 584 aa  113  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 674 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 865 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 		 654 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 865 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  47.15 
 
 		 701 aa  112  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 671 aa  112  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  44.88 
 
 		 720 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 702 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  43.2 
 
 		 761 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 1629 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  47.58 
 
 		 697 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 		 1012 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 2164 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0577  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 556 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.482834  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  33.81 
 
 		 662 aa  111  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0236  CheA signal transduction histidine kinases  45.52 
 
 		 654 aa  111  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 802 aa  111  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 1647 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1584  chemotaxis histidine protein kinase  45.52 
 
 		 654 aa  111  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.678464  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  43.62 
 
 		 1983 aa  110  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 604 aa  111  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.62 
 
 		 1180 aa  110  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 664 aa  110  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1729  CheA signal transduction histidine kinases  40.94 
 
 		 693 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 603 aa  110  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 		 2012 aa  110  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  43.06 
 
 		 1992 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 558 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 709 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.89 
 
 		 1971 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  44.09 
 
 		 887 aa  110  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.36 
 
 		 942 aa  110  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  39.39 
 
 		 674 aa  110  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  39.88 
 
 		 672 aa  110  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  40.49 
 
 		 662 aa  110  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  29.82 
 
 		 538 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  42.36 
 
 		 1987 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  39.39 
 
 		 681 aa  109  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  46.72 
 
 		 715 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 747 aa  109  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 687 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 1974 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  42.86 
 
 		 783 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  46.4 
 
 		 974 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  37.75 
 
 		 1010 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 697 aa  109  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>