More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1958 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6986  putative CheA signal transduction histidine kinase  60.46 
 
 
796 aa  926    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.813251  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3590  putative CheA signal transduction histidine kinase  60.18 
 
 
796 aa  925    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1958  sensor histidine kinase  100 
 
 
794 aa  1609    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4834  putative CheA signal transduction histidine kinase  61.37 
 
 
794 aa  962    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1979  putative CheA signal transduction histidine kinase  58.02 
 
 
793 aa  869    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4510  putative CheA signal transduction histidine kinase  59.2 
 
 
803 aa  890    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3455  putative CheA signal transduction histidine kinase  57.54 
 
 
795 aa  889    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3011  CheA signal transduction histidine kinases (STHK)  60.03 
 
 
796 aa  926    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3969  putative CheA signal transduction histidine kinase  58.29 
 
 
796 aa  877    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.191505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4298  putative CheA signal transduction histidine kinases  57.54 
 
 
795 aa  888    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3757  CheA signal transduction histidine kinase  61.37 
 
 
794 aa  962    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3462  putative CheA signal transduction histidine kinases  58.3 
 
 
796 aa  868    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4068  putative CheA signal transduction histidine kinases  57.54 
 
 
795 aa  888    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2118  CheA signal transduction histidine kinase  45.48 
 
 
780 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521154  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.26 
 
 
1023 aa  150  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  46.38 
 
 
2336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  42.4 
 
 
761 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
729 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
2423 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
709 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.11 
 
 
942 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  38.55 
 
 
2458 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
2164 aa  112  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  38.55 
 
 
2476 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  44.44 
 
 
1983 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
728 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  39.58 
 
 
2026 aa  109  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
2026 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0385  putative CheA signal transduction histidine kinases  24.57 
 
 
733 aa  109  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.222748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
686 aa  109  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 
1063 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  43.9 
 
 
707 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  40.91 
 
 
741 aa  108  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  37.88 
 
 
916 aa  108  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
666 aa  108  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  42.22 
 
 
681 aa  108  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  35.84 
 
 
801 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
916 aa  108  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
740 aa  108  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
830 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
713 aa  107  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  44.44 
 
 
669 aa  107  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
934 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  44.44 
 
 
662 aa  107  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
921 aa  107  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
685 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.29 
 
 
1971 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
935 aa  107  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
2539 aa  107  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
1974 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
685 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
1647 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  42.75 
 
 
1643 aa  106  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
1609 aa  106  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
747 aa  106  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
802 aa  105  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2327  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.86 
 
 
862 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
770 aa  105  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2285  CheA signal transduction histidine kinases  34.5 
 
 
584 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
1629 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  44.44 
 
 
719 aa  105  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
808 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
664 aa  105  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
921 aa  105  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  39.39 
 
 
561 aa  105  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
688 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
1078 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  39.26 
 
 
672 aa  105  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
1646 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
878 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
812 aa  104  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
808 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  33.33 
 
 
925 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1399  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  49.09 
 
 
693 aa  104  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
1646 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
679 aa  103  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0766  CheA signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
740 aa  104  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675512  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  34.72 
 
 
801 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0332  CheA signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
756 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  42.07 
 
 
681 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
937 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  41.67 
 
 
2092 aa  103  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
677 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
739 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
709 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
2137 aa  103  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 
652 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
937 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  43.38 
 
 
878 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
688 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
760 aa  102  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  37.86 
 
 
1987 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  45.31 
 
 
1956 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
750 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  37.99 
 
 
697 aa  102  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  41.67 
 
 
2070 aa  102  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  34.48 
 
 
2301 aa  102  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  42.06 
 
 
766 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 
732 aa  101  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  35.63 
 
 
2284 aa  102  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>