More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4834 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6986  putative CheA signal transduction histidine kinase  72.48 
 
 		 796 aa  1118    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.813251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1958  sensor histidine kinase  61.37 
 
 		 794 aa  962    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1979  putative CheA signal transduction histidine kinase  64.6 
 
 		 793 aa  995    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3455  putative CheA signal transduction histidine kinase  65.09 
 
 		 795 aa  1009    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3590  putative CheA signal transduction histidine kinase  70.22 
 
 		 796 aa  1088    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3011  CheA signal transduction histidine kinases (STHK)  72.1 
 
 		 796 aa  1105    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3757  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 794 aa  1620    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4510  putative CheA signal transduction histidine kinase  66.54 
 
 		 803 aa  1004    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4298  putative CheA signal transduction histidine kinases  65.27 
 
 		 795 aa  1013    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3462  putative CheA signal transduction histidine kinases  65.16 
 
 		 796 aa  986    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3969  putative CheA signal transduction histidine kinase  65.16 
 
 		 796 aa  992    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.191505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4068  putative CheA signal transduction histidine kinases  65.27 
 
 		 795 aa  1013    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4834  putative CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 794 aa  1620    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2118  CheA signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 780 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521154  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.15 
 
 		 1023 aa  146  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  37.5 
 
 		 878 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 762 aa  124  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 765 aa  124  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.63 
 
 		 1971 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 1629 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.26 
 
 		 764 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 783 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1568  CheA signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 739 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 808 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  36.92 
 
 		 2458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  36.92 
 
 		 2476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 767 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  47.24 
 
 		 887 aa  117  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  42.24 
 
 		 764 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  40.36 
 
 		 789 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 		 2423 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0619  CheA signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 		 794 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0110186 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 702 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 1647 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  29.79 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 1646 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 660 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 1646 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 694 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.67 
 
 		 942 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 760 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  40.96 
 
 		 793 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 666 aa  115  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 916 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 		 729 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  41.61 
 
 		 769 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 730 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 2539 aa  114  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 792 aa  114  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 		 921 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  43.62 
 
 		 916 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 		 709 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 751 aa  114  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 686 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 		 686 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 878 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 688 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 871 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.79 
 
 		 741 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 921 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 		 1974 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0577  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.482834  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 728 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 2012 aa  112  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 682 aa  112  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 974 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  37.7 
 
 		 662 aa  111  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 735 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  44.97 
 
 		 707 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 747 aa  111  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 732 aa  111  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 814 aa  111  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  39.35 
 
 		 720 aa  111  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 695 aa  111  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  38.32 
 
 		 761 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 1063 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  44.93 
 
 		 700 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  44.93 
 
 		 705 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  38.42 
 
 		 681 aa  110  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 755 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 1078 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.56 
 
 		 2336 aa  110  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 675 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 802 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 760 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  38.17 
 
 		 1983 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 957 aa  110  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0637  CheA signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 551 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0628  CheA signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 553 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 697 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 2009 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 1758 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 		 935 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 781 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 759 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 760 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  44.19 
 
 		 1010 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 742 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  34.69 
 
 		 742 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>