More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3969 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3455  putative CheA signal transduction histidine kinase  91.59 
 
 		 795 aa  1462    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1958  sensor histidine kinase  58.29 
 
 		 794 aa  893    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4510  putative CheA signal transduction histidine kinase  90.24 
 
 		 803 aa  1377    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4834  putative CheA signal transduction histidine kinase  65.16 
 
 		 794 aa  1009    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3757  CheA signal transduction histidine kinase  65.16 
 
 		 794 aa  1009    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1979  putative CheA signal transduction histidine kinase  90.7 
 
 		 793 aa  1434    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6986  putative CheA signal transduction histidine kinase  67.99 
 
 		 796 aa  1061    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.813251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3969  putative CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 796 aa  1611    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.191505 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3590  putative CheA signal transduction histidine kinase  69.16 
 
 		 796 aa  1074    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3011  CheA signal transduction histidine kinases (STHK)  68.12 
 
 		 796 aa  1058    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4298  putative CheA signal transduction histidine kinases  91.59 
 
 		 795 aa  1455    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3462  putative CheA signal transduction histidine kinases  98.49 
 
 		 796 aa  1584    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4068  putative CheA signal transduction histidine kinases  91.59 
 
 		 795 aa  1455    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2118  CheA signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 		 780 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521154  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.84 
 
 		 1023 aa  151  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  36.17 
 
 		 761 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2285  CheA signal transduction histidine kinases  35.24 
 
 		 584 aa  117  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1148  CheA signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 377 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  49.21 
 
 		 878 aa  114  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.86 
 
 		 974 aa  114  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 671 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 671 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 921 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  32.84 
 
 		 766 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  29.58 
 
 		 807 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 751 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  40.83 
 
 		 715 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 		 729 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 685 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 685 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 741 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  49.23 
 
 		 2012 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  53.1 
 
 		 750 aa  111  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41.29 
 
 		 705 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  47.29 
 
 		 871 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 878 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 558 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  43.84 
 
 		 700 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  45.31 
 
 		 887 aa  110  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0637  CheA signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 551 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 664 aa  110  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0628  CheA signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 553 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 742 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  41.76 
 
 		 916 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 		 1974 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0603  CheA signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 551 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 		 935 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 1065 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  42.98 
 
 		 801 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 916 aa  109  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 673 aa  108  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  37.79 
 
 		 927 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  43.09 
 
 		 739 aa  108  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  38.1 
 
 		 910 aa  108  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2487  CheA signal transduction histidine kinase  53.51 
 
 		 725 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  37.79 
 
 		 927 aa  108  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 921 aa  108  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 		 2009 aa  108  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2583  CheA signal transduction histidine kinase  53.98 
 
 		 711 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 682 aa  108  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  40 
 
 		 1104 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 697 aa  107  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 728 aa  107  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  42.41 
 
 		 684 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  48.36 
 
 		 538 aa  107  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  44.44 
 
 		 685 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 		 709 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  41.21 
 
 		 1888 aa  107  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  47.06 
 
 		 2336 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 679 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  39.88 
 
 		 561 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 2026 aa  106  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1770  CheA signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 633 aa  106  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 1012 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 808 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  40.88 
 
 		 2092 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 957 aa  106  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  39.56 
 
 		 2026 aa  105  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  41.03 
 
 		 719 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  40.91 
 
 		 674 aa  105  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 937 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.19 
 
 		 754 aa  105  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 674 aa  105  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  44.44 
 
 		 942 aa  105  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 		 732 aa  105  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 865 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  40.62 
 
 		 785 aa  105  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 865 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 937 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  40.61 
 
 		 552 aa  104  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 		 722 aa  105  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  41.46 
 
 		 744 aa  104  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  41.6 
 
 		 754 aa  105  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0611  CheA signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 683 aa  105  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.527763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  40.61 
 
 		 552 aa  104  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 		 2423 aa  104  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  46.83 
 
 		 702 aa  104  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  36.99 
 
 		 897 aa  104  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 747 aa  104  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0124085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>