More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2285 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2285  CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
584 aa  1192    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  35.52 
 
 
766 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
728 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
878 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  33.44 
 
 
888 aa  319  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
760 aa  314  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
770 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  33.95 
 
 
742 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  30.66 
 
 
801 aa  303  7.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
598 aa  292  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
604 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  29.29 
 
 
910 aa  282  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
603 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  30.72 
 
 
639 aa  274  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
607 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.51 
 
 
769 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  29.46 
 
 
769 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  30.13 
 
 
601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  29.35 
 
 
769 aa  270  5e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  29.85 
 
 
610 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.48 
 
 
942 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  36.57 
 
 
925 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
937 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
937 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
934 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3317  CheA signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
536 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
911 aa  263  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  35.75 
 
 
922 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
812 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  35.75 
 
 
934 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
921 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
792 aa  261  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
871 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
822 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  30.12 
 
 
561 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0721  CheA signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
544 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159017  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  34.63 
 
 
897 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  36.29 
 
 
927 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
1063 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  30.18 
 
 
552 aa  254  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3196  CheA signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
542 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  30.18 
 
 
552 aa  254  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  36.55 
 
 
927 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.79 
 
 
767 aa  253  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
921 aa  252  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
935 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  36.95 
 
 
928 aa  252  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.89 
 
 
754 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
691 aa  251  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  35 
 
 
748 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
695 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  33.91 
 
 
916 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
916 aa  251  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
739 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
737 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.75 
 
 
758 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  36.73 
 
 
870 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
747 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
543 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
743 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
747 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  28.62 
 
 
598 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  28.77 
 
 
927 aa  246  8e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  33.73 
 
 
744 aa  246  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  31.34 
 
 
1104 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
796 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0603  CheA signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
551 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  34.44 
 
 
819 aa  243  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  29.77 
 
 
625 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
681 aa  243  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
673 aa  241  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
660 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  32.94 
 
 
744 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
699 aa  240  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
649 aa  241  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  29.95 
 
 
807 aa  240  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0636  CheA signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
544 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83539e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  30.92 
 
 
538 aa  240  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.28 
 
 
734 aa  239  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
1085 aa  239  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  34.1 
 
 
753 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  34.1 
 
 
748 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
696 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
670 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
650 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0647  CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
558 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188659  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
745 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  33.83 
 
 
785 aa  233  8.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
697 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
686 aa  233  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  31.77 
 
 
714 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.99 
 
 
734 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
715 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
691 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2112  CheA signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
565 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
733 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
652 aa  230  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
733 aa  231  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
746 aa  230  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  33.09 
 
 
1089 aa  230  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>