More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0353 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 		 1023 aa  2090    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1555  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.08 
 
 		 821 aa  266  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.202695  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4298  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.59 
 
 		 795 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4068  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.59 
 
 		 795 aa  171  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.949854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3590  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 796 aa  170  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3455  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 795 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1979  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 793 aa  168  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4510  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 803 aa  162  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3462  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.99 
 
 		 796 aa  161  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1958  sensor histidine kinase  27.26 
 
 		 794 aa  160  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3969  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 796 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.191505 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4834  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 794 aa  157  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3757  CheA signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 794 aa  157  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6986  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 796 aa  154  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.813251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3011  CheA signal transduction histidine kinases (STHK)  26.14 
 
 		 796 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.5 
 
 		 677 aa  145  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000502143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 660 aa  145  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2118  CheA signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 780 aa  144  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521154  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.78 
 
 		 657 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 733 aa  141  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  34.91 
 
 		 761 aa  141  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 729 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  37.89 
 
 		 751 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 666 aa  138  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03242  chemotaxis protein CheA  39.69 
 
 		 913 aa  139  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  37.89 
 
 		 801 aa  137  7.000000000000001e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 691 aa  137  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 741 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 691 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  36.84 
 
 		 744 aa  136  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 606 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 677 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0577  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 556 aa  135  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.482834  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 687 aa  135  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 919 aa  135  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0361  CheW-like protein  36.36 
 
 		 897 aa  135  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.30104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 603 aa  135  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.84 
 
 		 927 aa  134  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 697 aa  134  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 687 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 808 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 713 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  37.77 
 
 		 601 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.02 
 
 		 783 aa  134  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 746 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  33.02 
 
 		 785 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  37.89 
 
 		 739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  35.79 
 
 		 744 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 604 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  34.42 
 
 		 770 aa  133  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  33.49 
 
 		 769 aa  132  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.08 
 
 		 754 aa  132  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 671 aa  132  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 671 aa  132  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  33.49 
 
 		 769 aa  132  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 747 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 728 aa  132  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 920 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.05 
 
 		 758 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.74 
 
 		 639 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 685 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 685 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 688 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  35.79 
 
 		 754 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 701 aa  132  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  37.37 
 
 		 714 aa  132  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  35.05 
 
 		 748 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 919 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  34.74 
 
 		 702 aa  131  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 812 aa  131  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  33.87 
 
 		 561 aa  131  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  35.26 
 
 		 1104 aa  131  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 743 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 747 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1859  CheA signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 614 aa  131  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 759 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  38.17 
 
 		 598 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  36.32 
 
 		 552 aa  130  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  32.26 
 
 		 770 aa  130  9.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  36.32 
 
 		 552 aa  130  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 739 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.74 
 
 		 803 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  37.37 
 
 		 762 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 957 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  32.56 
 
 		 774 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 737 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  34.57 
 
 		 610 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  36.84 
 
 		 758 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 681 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  36.32 
 
 		 767 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 598 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  36.32 
 
 		 734 aa  130  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 745 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 655 aa  129  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  38.3 
 
 		 720 aa  129  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  33.02 
 
 		 769 aa  129  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2230  CheA signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 592 aa  129  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.375764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0766  CheA signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 740 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675512  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.37 
 
 		 734 aa  128  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>