More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4068 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3969  putative CheA signal transduction histidine kinase  91.59 
 
 
796 aa  1432    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.191505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1958  sensor histidine kinase  57.54 
 
 
794 aa  888    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1979  putative CheA signal transduction histidine kinase  93.21 
 
 
793 aa  1478    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6986  putative CheA signal transduction histidine kinase  67.48 
 
 
796 aa  1050    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.813251  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3455  putative CheA signal transduction histidine kinase  98.62 
 
 
795 aa  1588    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3011  CheA signal transduction histidine kinases (STHK)  66.97 
 
 
796 aa  1040    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4298  putative CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
795 aa  1610    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3590  putative CheA signal transduction histidine kinase  69 
 
 
796 aa  1074    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3757  CheA signal transduction histidine kinase  65.27 
 
 
794 aa  1013    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3462  putative CheA signal transduction histidine kinases  90.7 
 
 
796 aa  1419    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.924475 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4068  putative CheA signal transduction histidine kinases  100 
 
 
795 aa  1610    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.949854  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4510  putative CheA signal transduction histidine kinase  89.92 
 
 
803 aa  1383    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4834  putative CheA signal transduction histidine kinase  65.27 
 
 
794 aa  1013    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2118  CheA signal transduction histidine kinase  46.57 
 
 
780 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.521154  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  27.59 
 
 
1023 aa  160  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
741 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  30.22 
 
 
807 aa  126  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 
2423 aa  127  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
742 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  45.22 
 
 
2458 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  45.22 
 
 
2476 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 
664 aa  124  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  43.29 
 
 
1065 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.45 
 
 
974 aa  124  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0810  CheA signal transduction histidine kinases  39.66 
 
 
715 aa  124  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  39.64 
 
 
739 aa  124  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 
709 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1009  chemotaxis protein CheA  35.71 
 
 
761 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 
682 aa  122  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
675 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  38.46 
 
 
910 aa  121  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  43.79 
 
 
709 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 
729 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0611  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
683 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.527763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  46.05 
 
 
625 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  43.87 
 
 
681 aa  120  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
921 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1851  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
814 aa  120  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59721  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
724 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  45.39 
 
 
705 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  42.31 
 
 
684 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  43.14 
 
 
2336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
878 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  47.69 
 
 
878 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 
671 aa  119  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  45.39 
 
 
700 aa  119  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.18 
 
 
1971 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
1629 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
687 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2427  CheA signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
702 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84182  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0603  CheA signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
551 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6737  chemotaxis protein cheA  41.32 
 
 
681 aa  118  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  45.39 
 
 
639 aa  118  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1148  CheA signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
377 aa  118  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 
671 aa  118  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1647 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  37.99 
 
 
610 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 
728 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
686 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  33.67 
 
 
766 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  43.07 
 
 
887 aa  117  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  39.89 
 
 
701 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1646 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
937 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
685 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
685 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1770  CheA signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
633 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1646 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
937 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
762 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
607 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
694 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
679 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0145  CheA signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
688 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
808 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
747 aa  115  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
598 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  40.31 
 
 
719 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0628  CheA signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
553 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0637  CheA signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
551 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
673 aa  115  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
935 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  35 
 
 
660 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
655 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  42.35 
 
 
916 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  41.86 
 
 
754 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  44.09 
 
 
734 aa  115  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  43.23 
 
 
662 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
751 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
934 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1607  CheA signal transduction histidine kinases  43.36 
 
 
707 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
1974 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 
916 aa  114  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
760 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  37.79 
 
 
925 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
735 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
666 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
686 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
741 aa  114  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>