More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6787 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6787  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
790 aa  1560    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148112  normal  0.39723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  29.73 
 
 
734 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
742 aa  273  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
762 aa  272  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
741 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  26.77 
 
 
769 aa  265  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  31 
 
 
752 aa  264  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  26.5 
 
 
769 aa  262  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  26.47 
 
 
769 aa  260  6e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  26.71 
 
 
774 aa  250  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0714  CheA signal transduction histidine kinases  28.16 
 
 
1020 aa  249  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  26.53 
 
 
770 aa  248  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  25.76 
 
 
770 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.23 
 
 
789 aa  241  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
1907 aa  240  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
865 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
865 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
1137 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
740 aa  238  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
1125 aa  238  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
755 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.16 
 
 
764 aa  234  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  28.19 
 
 
764 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
1065 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 
808 aa  232  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
808 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.66 
 
 
769 aa  231  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
1078 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
801 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
758 aa  227  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2780  CheA signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
1736 aa  227  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1014  CheA signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 
928 aa  227  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.186099  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
753 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  34.33 
 
 
793 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
750 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
756 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
2539 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
679 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  26.46 
 
 
803 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
765 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  29.24 
 
 
766 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
762 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
760 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
673 aa  220  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
777 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
713 aa  220  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  34.86 
 
 
839 aa  220  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
2212 aa  220  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
671 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
666 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
767 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.03 
 
 
1956 aa  219  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
679 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.39 
 
 
1992 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
649 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.97 
 
 
1971 aa  218  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
2414 aa  217  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
878 aa  217  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
756 aa  217  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
695 aa  217  8e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
770 aa  217  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
681 aa  217  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.06 
 
 
864 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
674 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
691 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
650 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.06 
 
 
864 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  26.66 
 
 
652 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  31.06 
 
 
1079 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
671 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  30.89 
 
 
864 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
911 aa  214  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  30.89 
 
 
864 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  30.89 
 
 
864 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  30.89 
 
 
864 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
673 aa  214  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.48 
 
 
1960 aa  213  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  28.07 
 
 
1834 aa  213  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
1725 aa  213  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
1725 aa  213  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.02 
 
 
1180 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
781 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
2164 aa  212  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  28.71 
 
 
714 aa  211  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.53 
 
 
1866 aa  211  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3744  CheA signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
1155 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
1127 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
769 aa  211  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  31.37 
 
 
769 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  31.37 
 
 
769 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  31.28 
 
 
692 aa  210  9e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  28.57 
 
 
1643 aa  210  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  25.89 
 
 
801 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
871 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
766 aa  210  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
2423 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
769 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  29.69 
 
 
832 aa  209  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
911 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
675 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>