More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0928 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  50 
 
 		 321 aa  126  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  52.29 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0533  response regulator receiver  40.5 
 
 		 331 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 935 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  40.17 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  40.17 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  40.17 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 301 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 231 aa  84  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  40.17 
 
 		 184 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.02 
 
 		 331 aa  83.6  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2365  response regulator  40.17 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0507546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.17 
 
 		 331 aa  83.6  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  40.17 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  40.17 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3511  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.84 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0622  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0453  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.986392 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  38.39 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0572  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 331 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3458  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 331 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  34.96 
 
 		 331 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 331 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 331 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 331 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0571  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 331 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3136  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.17 
 
 		 335 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.823332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 331 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3305  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.25 
 
 		 331 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 318 aa  80.1  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  37.5 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  39.25 
 
 		 322 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  39.5 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  38.66 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  38.66 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 944 aa  77  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2547  response regulator  38.98 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  38.66 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 945 aa  76.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 		 801 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0902  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.308515  decreased coverage  0.000000063687 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0648  protein-glutamate methylesterase  39.81 
 
 		 372 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.109411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  36.52 
 
 		 344 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0886  response regulator receiver  36.94 
 
 		 334 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0841257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  37.84 
 
 		 334 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 243 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  35.48 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.16 
 
 		 385 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1817  putative two-component response regulator  34.17 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  38.46 
 
 		 414 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 457 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  39.82 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0922  response regulator protein  34.51 
 
 		 327 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 922 aa  73.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1110  response regulator receiver domain-containing protein  35.19 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00277439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.2 
 
 		 900 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.93 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0751  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 485 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0880271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 457 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.69 
 
 		 394 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1417  two component Fis family transcriptional regulator  39 
 
 		 492 aa  72  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1725 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2939  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35 
 
 		 458 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2807  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 466 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  37.62 
 
 		 368 aa  72  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>