More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2684 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 321 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0955  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0928  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1438  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0726214  normal  0.0482802 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  39.5 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 248 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  40.83 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 945 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 1609 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2585  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 385 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2489  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 385 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1368  response regulator receiver domain-containing protein  43.12 
 
 		 386 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.43 
 
 		 243 aa  85.1  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5599  response regulator receiver  39.66 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.833931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 242 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  38.98 
 
 		 2301 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  36.75 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  36.75 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  38.98 
 
 		 2284 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.5 
 
 		 2336 aa  82  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  35.9 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 944 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 935 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 1012 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  36.04 
 
 		 1153 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.58 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2074  two component Fis family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2329  response regulator receiver  36.97 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  35.34 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  35.34 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  35.34 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  38.66 
 
 		 2458 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  39.32 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  38.66 
 
 		 2476 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  34.48 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  32.77 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 254 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  38.46 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2297  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 		 484 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0617558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  37.82 
 
 		 225 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  38.46 
 
 		 254 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  37.17 
 
 		 781 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.66 
 
 		 974 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 941 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2118  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.14 
 
 		 238 aa  77.4  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  37.61 
 
 		 254 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  36.13 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2150  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 443 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 223 aa  77.4  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 229 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  35.9 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  34.19 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 225 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  35.29 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 232 aa  77  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.19 
 
 		 230 aa  77  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>